RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530036.1

RPUSD4-204, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, human

TSL 3

Gene RPUSD4, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD4-204	ENST00000530036	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LTC4S	Q16873	150 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	MORN2	Q502X0	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	GALM	Q96C23	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SSX3	Q99909	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036		A0A1W2PPE3	182 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036		A0A1W2PPI3	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036		H3BUX3	64 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	FABP7	O15540	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RGS11	O94810	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SCT	P09683	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PTHLH	P12272	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	MNDA	P41218	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	INPP1	P49441	399 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RAB7A	P51149	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF134	P52741	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PPP5C	P53041	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TAS2R20	P59543	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	GNG2	P59768	71 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SSX2	Q16385	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CFHR4	Q92496	578 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036		A6NDX4	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036		J3QRK9	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HSD17B6	O14756	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TIMM23	O14925	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HSPA12A	O43301	675 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TXNL1	O43396	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LANCL1	O43813	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CHST1	O43916	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	GPR137B	O60478	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TPPP	O94811	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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