RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524361.5

LINC00534-204, long intergenic non-protein coding RNA 534, human

TSL 3

Gene LINC00534, Length 620 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00534-204	ENST00000524361	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	RAB25	P57735	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	ZP1	P60852	638 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	ZNF691	Q5VV52	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	GPER1	Q99527	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	ING4	Q9UNL4	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361		A0A1W2PPI3	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	CBY3	A6NI87	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	GABRP	O00591	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	CIB2	O75838	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	IL1A	P01583	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	ALPL	P05186	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	CSN2	P05814	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	RASSF2	P50749	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	RSU1	Q15404	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	XAF1	Q6GPH4	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361		A0A1W2PP11	408 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361		A0A1W2PPK0	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361		H3BNX3	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361		M0QZK8	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	CCL24	O00175	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	CCRL2	O00421	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	RAB3A	P20336	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	STPG2	Q8N412	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00534-204	ENST00000524361	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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