RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 NDUFS8O00217 210 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 GPR31O00270 319 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 YPEL1O60688 119 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 OR8U9P0C7N5 309 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 S100GP29377 79 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 GNRHRP30968 328 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 PIGPP57054 158 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 LOXL3P58215 753 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 DSCR9P59020 149 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 GNB2P62879 340 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 DHRS2Q13268 280 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 PPP1R1AQ13522 171 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF273Q14593 569 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 GNMTQ14749 295 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 LTC4SQ16873 150 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 MORN2Q502X0 79 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 CD276Q5ZPR3 534 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 TCF23Q7RTU1 214 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 SGPP2Q8IWX5 399 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 OR8U1Q8NH10 309 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 FAM168AQ92567 244 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 NRGNQ92686 78 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM230Q96A57 120 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 RAB39BQ96DA2 213 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 YPEL2Q96QA6 119 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.6□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 HSD17B6O14756 317 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 SLC22A5O76082 557 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 SFT2D2O95562 160 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 IFNA2P01563 188 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 OMGP23515 440 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 NFYBP25208 207 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 RND3P61587 244 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 MSMO1Q15800 293 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 ESCO2Q56NI9 601 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 AKAP14Q86UN6 197 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 PERPQ96FX8 193 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 PHB2Q99623 299 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.59□□□□□ -1.03
TRPS1-210ENST00000519815 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 ITGB1BP1O14713 200 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 MPPED1O15442 326 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 CCNKO75909 580 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 IGHV2-5P01817 119 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 ANXA3P12429 323 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 CCL3L1P16619 93 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 CD34P28906 385 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 DLX6P56179 175 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 KCTD9Q7L273 389 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 BVESQ8NE79 360 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 MITD1Q8WV92 249 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 NEURL2Q9BR09 285 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 NAA60Q9H7X0 242 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 RNF150Q9ULK6 438 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 PSG11Q9UQ72 335 aa8.58□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-210ENST00000519815 A0A0B4J2A0 478 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms