RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 CD80P33681 288 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 CDSNQ15517 529 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 THAP6Q8TBB0 222 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 CCL17Q92583 94 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 NEUROG1Q92886 237 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 GAFA1Q96PS6 74 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 YPEL2Q96QA6 119 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 SPIN2AQ99865 258 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 JPT1Q9UK76 154 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 GAB2Q9UQC2 676 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 HSPB11Q9Y547 144 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.25□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 FAM25EA8MYX2 175 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 SMLR1H3BR10 107 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 NDUFB3O43676 98 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 ATG12O94817 140 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 OR2F2O95006 317 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 MPC2O95563 127 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 GYPAP02724 150 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 RLN2P04090 185 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 OR5AC1P0C628 307 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 SLC25A6P12236 298 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 IGFBP2P18065 325 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 UCP1P25874 307 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 UQCRFS1P47985 274 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 RAB7AP51149 207 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 CATR1Q13166 79 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 OR2F1Q13607 317 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF345Q14585 488 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 Q3ZCU0 254 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF546Q86UE3 836 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 DTX2Q86UW9 622 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF695Q8IW36 515 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 PRR18Q8N4B5 295 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 OR1L1Q8NH94 360 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 RAB39BQ96DA2 213 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 SEC22AQ96IW7 307 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 C18orf12Q96KH6 178 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 CCL13Q99616 98 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 CLN8Q9UBY8 286 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.24□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 L7N2F9 121 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 HSD17B6O14756 317 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 TMPRSS2O15393 492 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF205O95201 554 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 SERPINE2P07093 398 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 HOXB5P09067 269 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 OR8U9P0C7N5 309 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 DANCRP0C864 163 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 LYL1P12980 280 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 VDAC1P21796 283 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 S100A11P31949 105 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 EDDM3BP56851 147 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 IL15RAQ13261 267 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 EDDM3AQ14507 147 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 NDUFA5Q16718 116 aa6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 MORN2Q502X0 79 aa6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms