RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 UNC80Q8N2C7 3258 aa4.41□□□□□ -1.7
PGGT1B-205ENST00000514178 ADGRB1O14514 1584 aa4.4□□□□□ -1.7
PGGT1B-205ENST00000514178 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.7
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa4.4□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM250H0YL14 139 aa4.4□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 CNTFRP26992 372 aa4.4□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 GDI2P50395 445 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM53BQ14153 422 aa4.4□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 DNLZQ5SXM8 178 aa4.4□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 DTD1Q8TEA8 209 aa4.4□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 RBP7Q96R05 134 aa4.4□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa4.4□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 LMO7Q8WWI1 1683 aa4.4□□□□□ -1.71
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PGGT1B-205ENST00000514178 IGLL5B9A064 214 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 MP68P56378 58 aa4.39□□□□□ -1.71
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PGGT1B-205ENST00000514178 LY6EQ16553 131 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TBC1D28Q2M2D7 210 aa4.39□□□□□ -1.71
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PGGT1B-205ENST00000514178 AMN1Q8IY45 258 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 OR11L1Q8NGX0 322 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 STOML3Q8TAV4 291 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 YIPF5Q969M3 257 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 CHST5Q9GZS9 411 aa4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 VSIRQ9H7M9 311 aa4.39□□□□□ -1.71
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PGGT1B-205ENST00000514178 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 QRICH2Q9H0J4 1663 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 HPGDSO60760 199 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 HLA-DMAP28067 261 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 S100A2P29034 98 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 COILP38432 576 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 HSPA13P48723 471 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB2AP61019 212 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 C4orf26Q17RF5 130 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 LAIR2Q6ISS4 152 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SGPP2Q8IWX5 399 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFP82Q8N141 532 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIP11Q15643 1979 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa4.38□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 VCANP13611 3396 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PKD1L2Q7Z442 2459 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 F5H5P2 479 aa4.37□□□□□ -1.71
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PGGT1B-205ENST00000514178 PTHLHP12272 177 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SKP2Q13309 424 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 MED21Q13503 144 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
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PGGT1B-205ENST00000514178 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM251Q8N6I4 163 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 MAL2Q969L2 176 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 RMI2Q96E14 147 aa4.37□□□□□ -1.71
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PGGT1B-205ENST00000514178 REEP6Q96HR9 211 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SEC22CQ9BRL7 303 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 METTL9Q9H1A3 318 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TXNIPQ9H3M7 391 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 WNK3Q9BYP7 1800 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa4.37□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 COL18A1P39060 1754 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 DAPL1A0PJW8 107 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 K7ERS5 55 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 POP7O75817 140 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
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PGGT1B-205ENST00000514178 RNF182Q8N6D2 247 aa4.36□□□□□ -1.71
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PGGT1B-205ENST00000514178 CMTM5Q96DZ9 223 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 MTCH2Q9Y6C9 303 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 KIF13BQ9NQT8 1826 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PIEZO1Q92508 2521 aa4.36□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa4.35□□□□□ -1.71
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