RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, human

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLK-215	ENST00000514141	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	DLL1	O00548	723 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	SPP1	P10451	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	CA7	P43166	264 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	TGIF1	Q15583	401 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	TBR1	Q16650	682 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	CCS	O14618	274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	APOC3	P02656	99 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	ORM1	P02763	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	GNB2	P62879	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	C4orf17	Q53FE4	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	LHX4	Q969G2	390 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141		H3BSH0	61 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	CNIH1	O95406	144 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	CXorf1	O96002	111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	OPN1MW	P04001	364 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	CECR9	P0C854	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	TMEM187	Q14656	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	AVPI1	Q5T686	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141		A0A1W2PS18	150 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	FBXO24	O75426	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	LYL1	P12980	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	COL10A1	Q03692	680 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	AMELY	Q99218	206 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	CDIPT	O14735	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	SSSCA1	O60232	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	HBZ	P02008	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	DEFA4	P12838	97 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	TMEM50B	P56557	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	NRTN	Q99748	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
POLK-215	ENST00000514141	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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