RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509677.5

SH3BP2-214, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-214ENST00000509677 HSPA12AO43301 675 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 YPEL1O60688 119 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 RAB7AP51149 207 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 RAG2P55895 527 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 GNG2P59768 71 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 RELBQ01201 579 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 LYG1Q8N1E2 194 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 C3orf56Q8N813 242 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 DTX3Q8N9I9 347 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 YPEL2Q96QA6 119 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 RAB18Q9NP72 206 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 HSD17B6O14756 317 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 CHST1O43916 411 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 GSTT2P0CG29 244 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 GSTT2BP0CG30 244 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 CEACAM6P40199 344 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 KIR2DS4P43632 304 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 FOXL1Q12952 345 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 KIR2DS1Q14954 304 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 AWAT1Q58HT5 328 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 DRAM1Q8N682 238 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 OR56B4Q8NH76 319 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 ABCG5Q9H222 651 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 A0A1W2PPI3 338 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 DTYMKP23919 212 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 ZBTB25P24278 435 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 TMBIM6P55061 237 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 PITPNAQ00169 270 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 SPCS2Q15005 226 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 HERPUD1Q15011 391 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 MOB3BQ86TA1 216 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 OR8H3Q8N146 312 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 OR4F5Q8NH21 305 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 BET1O15155 118 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 ST8SIA5O15466 376 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 XRCC3O43542 346 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 SSX5O60225 188 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 NDUFA7O95182 113 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 IGSF11Q5DX21 431 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 Q6ZSV7 163 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 AP3S1Q92572 193 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 HPGDSO60760 199 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 LPLP06858 475 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 FAM106CPP0CH98 169 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 PTHLHP12272 177 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF137PP52743 207 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 FBLN7Q53RD9 439 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 MZT2AQ6P582 158 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 CFHR4Q92496 578 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 BEX1Q9HBH7 125 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 APOA1P02647 267 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 OR3A3P47888 321 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 HES1Q14469 280 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 Q6ZS49 121 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 ISOC1Q96CN7 298 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 RDH8Q9NYR8 311 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-214ENST00000509677 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms