RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 NDUFA7O95182 113 aa11.75□□□□□ -0.53
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SH3BP2-208ENST00000504294 C11orf88Q6PI97 169 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 OR10V1Q8NGI7 309 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A38Q96DW6 304 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 DUX5Q96PT3 197 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 S1PR3Q99500 378 aa11.75□□□□□ -0.53
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SH3BP2-208ENST00000504294 SLC22A5O76082 557 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 SCTP09683 121 aa11.73□□□□□ -0.53
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SH3BP2-208ENST00000504294 PLA1AQ53H76 456 aa11.73□□□□□ -0.53
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SH3BP2-208ENST00000504294 LYG1Q8N1E2 194 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4C13Q8NGP0 309 aa11.73□□□□□ -0.53
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SH3BP2-208ENST00000504294 ARPC4P59998 168 aa11.72□□□□□ -0.53
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SH3BP2-208ENST00000504294 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa11.72□□□□□ -0.53
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SH3BP2-208ENST00000504294 C16orf95Q9H693 158 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 RDH8Q9NYR8 311 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 ANXA10Q9UJ72 324 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PPE3 182 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 TIMM23O14925 209 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF134P52741 427 aa11.7□□□□□ -0.54
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SH3BP2-208ENST00000504294 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SH3BP2-208ENST00000504294 HES1Q14469 280 aa11.7□□□□□ -0.54
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