RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495606.5

IMP4-217, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene IMP4, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-217ENST00000495606 TAS2R20P59543 309 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 C12orf54Q6X4T0 127 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 TMEM219Q86XT9 240 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 LYG1Q8N1E2 194 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 LINC00311Q8N616 119 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 FAM216AQ8WUB2 273 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 TOMM40LQ969M1 308 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 RPEQ96AT9 228 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 OCSTAMPQ9BR26 566 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 MIXL1Q9H2W2 232 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 RAB9BQ9NP90 201 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 ABCB10Q9NRK6 738 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 JPT1Q9UK76 154 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 RNF150Q9ULK6 438 aa11.67□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 HSPA12AO43301 675 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 YPEL1O60688 119 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 OR3A3P47888 321 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 TMEM69Q5SWH9 247 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 MZT2AQ6P582 158 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 TMEM86BQ8N661 226 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 DRAM1Q8N682 238 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 YPEL2Q96QA6 119 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 VPREB3Q9UKI3 123 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 POMT1Q9Y6A1 747 aa11.66□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 A0A0A6YYH2 397 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 BTBD17A6NE02 478 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 A6NJ64 397 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 J3QRK9 145 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 TIMM23O14925 209 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 CHST1O43916 411 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 HLA-DQB1P01920 261 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 APOA1P02647 267 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 DTYMKP23919 212 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 SOX6P35712 828 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 CEACAM3P40198 252 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 MNDAP41218 407 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 ACTG1P63261 375 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 RELBQ01201 579 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 ARL6IP1Q15041 203 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 MOB3BQ86TA1 216 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 ODF3L1Q8IXM7 274 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 OR4A4PQ8NGN8 299 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 OR56B4Q8NH76 319 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 CAPSLQ8WWF8 208 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 AP3S1Q92572 193 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 ABHD14BQ96IU4 210 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 RDH8Q9NYR8 311 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 MGAT4AQ9UM21 535 aa11.65□□□□□ -0.54
IMP4-217ENST00000495606 A0A1W2PPI3 338 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 DPPA5A6NC42 116 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 A6NDX4 124 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 VGLL3A8MV65 326 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 HSD17B6O14756 317 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 RGS5O15539 181 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 ZBTB25P24278 435 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 HNF4GQ14541 408 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 TMEM30BQ3MIR4 351 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 RPL39P5Q59GN2 51 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 STEAP3Q658P3 488 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 LAX1Q8IWV1 398 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 OR2AK2Q8NG84 335 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 OR5R1Q8NH85 324 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 CREB3L1Q96BA8 519 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 IFI27L2Q9H2X8 130 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 C1RLQ9NZP8 487 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 EXTL2Q9UBQ6 330 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 TCF19Q9Y242 345 aa11.64□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 POM121CA8CG34 1229 aa11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 RGS11O94810 467 aa11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 KIR2DS4P43632 304 aa11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 LINC00205P59089 165 aa11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 PITPNAQ00169 270 aa11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 KIR2DS1Q14954 304 aa11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 AANATQ16613 207 aa11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 Q3ZCU0 254 aa11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 FOXB2Q5VYV0 432 aa11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 ZFAND2BQ8WV99 257 aa11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 CFHR4Q92496 578 aa11.63□□□□□ -0.55
IMP4-217ENST00000495606 CMTM3Q96MX0 182 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms