RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 NPBQ8NG41 125 aa4.66□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 OR10H4Q8NGA5 316 aa4.66□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 CCDC107Q8WV48 283 aa4.66□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 RDH12Q96NR8 316 aa4.66□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 GPER1Q99527 375 aa4.66□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.66□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
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CBX1-205ENST00000495350 STEAP3Q658P3 488 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 IL34Q6ZMJ4 242 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
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CBX1-205ENST00000495350 ZNF439Q8NDP4 499 aa4.65□□□□□ -1.67
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CBX1-205ENST00000495350 OR10AC1Q8NH08 325 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 CT45A3Q8NHU0 189 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 GRPEL2Q8TAA5 225 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa4.65□□□□□ -1.67
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CBX1-205ENST00000495350 FBXL15Q9H469 300 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 OR2S2Q9NQN1 319 aa4.65□□□□□ -1.67
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CBX1-205ENST00000495350 ST3GAL6Q9Y274 331 aa4.65□□□□□ -1.67
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CBX1-205ENST00000495350 H7C2Y5 167 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 M0R129 80 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 SLC22A1O15245 554 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 SLC16A6O15403 523 aa4.64□□□□□ -1.67
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CBX1-205ENST00000495350 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
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CBX1-205ENST00000495350 C6orf141Q5SZD1 244 aa4.64□□□□□ -1.67
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CBX1-205ENST00000495350 S100A13Q99584 98 aa4.64□□□□□ -1.67
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CBX1-205ENST00000495350 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 OR5H14A6NHG9 310 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 MCRIP1C9JLW8 97 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 SPRY2O43597 315 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 RBBP9O75884 186 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 CA2P00918 260 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1-205ENST00000495350 IFNA4P05014 189 aa4.63□□□□□ -1.67
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