RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM203	Q969S6	136 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	KCTD7	Q96MP8	289 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	GON7	Q9BXV9	100 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A0A6YYD4	124 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	ST8SIA5	O15466	376 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	YPEL1	O60688	119 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	SRM	P19623	302 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC6A1	P30531	599 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	AQP4	P55087	323 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	ACTB	P60709	375 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	HTD2	P86397	168 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	P2RY14	Q15391	338 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	SPHAR	Q15513	63 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	PHYHIP	Q92561	330 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	GALM	Q96C23	342 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	YPEL2	Q96QA6	119 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618	SCN3B	Q9NY72	215 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATG4B-223	ENST00000493618		G3V318	75 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ELANE	P08246	267 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	QRFP	P83859	136 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	RNLS	Q5VYX0	342 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	STEAP3	Q658P3	488 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	SVOP	Q8N4V2	548 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	OR8U1	Q8NH10	309 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	UFD1	Q92890	307 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	GFI1	Q99684	422 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	PARP11	Q9NR21	331 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC22A1	O15245	554 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ATP6V0E1	O15342	81 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	SOCS1	O15524	211 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	RGS11	O94810	467 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHG4	P01861	327 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	UCHL1	P09936	223 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	HSMCR30	P0CW71	290 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	IRF3	Q14653	427 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	RNF152	Q8N8N0	203 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5B12	Q96R08	314 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	TM2D1	Q9BX74	207 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	KLK15	Q9H2R5	256 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	AK3	Q9UIJ7	227 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	NBR2	O15453	112 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	BPNT1	O95861	308 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	NAPSA	O96009	420 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	IGF1	P05019	195 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	PSMB8	P28062	276 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	DGCR2	P98153	550 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	CD69	Q07108	199 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	OR51J1	Q9H342	316 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	GNB4	Q9HAV0	340 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	HLA-DRB1	P01911	266 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	MAP2K4	P45985	399 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATG4B-223	ENST00000493618	CLDN12	P56749	244 aa		11.42	□□□□□ -0.58

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