RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 LINC00574Q9H8X3 128 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 PIPOXQ9P0Z9 390 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 MIOXQ9UGB7 285 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 LOXL3P58215 753 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 SP6Q3SY56 376 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 LY6G6FQ5SQ64 297 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 NOXA1Q86UR1 476 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 OR2T35Q8NGX2 323 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 ASB13Q8WXK3 278 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa22.15■■□□□ 1.14
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HOXB3-210ENST00000489475 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 RGS11O94810 467 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM30BQ3MIR4 351 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 MORN2Q502X0 79 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM200BQ69YZ2 307 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 YPEL2Q96QA6 119 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 RAB18Q9NP72 206 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 CCSO14618 274 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 TNFSF12O43508 249 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
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HOXB3-210ENST00000489475 ZNF645Q8N7E2 425 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 CCL19Q99731 98 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 OR2D2Q9H210 308 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa22.14■■□□□ 1.13
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HOXB3-210ENST00000489475 CLEC18CQ8NCF0 446 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 OR8B3Q8NGG8 313 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 FAM216AQ8WUB2 273 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF714Q96N38 554 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 OR8B2Q96RD0 313 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 TP53RKQ96S44 253 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 PDCD10Q9BUL8 212 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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HOXB3-210ENST00000489475 DRAM1Q8N682 238 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 GLYATL2Q8WU03 294 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 IGFBPL1Q8WX77 278 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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HOXB3-210ENST00000489475 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 GFOD1Q9NXC2 390 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 PSG11Q9UQ72 335 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 GPR37O15354 613 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 PLA2G2AP14555 144 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 LIAT1Q6ZQX7 453 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 ZBTB34Q8NCN2 500 aa22.12■■□□□ 1.13
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HOXB3-210ENST00000489475 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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HOXB3-210ENST00000489475 ZNF841Q6ZN19 808 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 OR52M1Q8NGK5 317 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM222Q9H0R3 208 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 J3QKU1 62 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 WNT2P09544 360 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 F2RP25116 425 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 NFYBP25208 207 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 GZMKP49863 264 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 MSMO1Q15800 293 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 LGI3Q8N145 548 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 OR10A7Q8NGE5 316 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 ST8SIA5O15466 376 aa22.1■■□□□ 1.13
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HOXB3-210ENST00000489475 DNASE1P24855 282 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 LRTM2Q8N967 370 aa22.1■■□□□ 1.13
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HOXB3-210ENST00000489475 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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HOXB3-210ENST00000489475 SEC22AQ96IW7 307 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 HEPN1Q6WQI6 88 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 ABHD14BQ96IU4 210 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-210ENST00000489475 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 RNF212BA8MTL3 300 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 ITGB1BP1O14713 200 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 MMP23AO75900 390 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 IFNA21P01568 189 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 IGHV3-7P01780 117 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 RAB7AP51149 207 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 LEAP2Q969E1 77 aa22.07■■□□□ 1.12
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