RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM56Q96MV1 263 aa8.64□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CCL13Q99616 98 aa8.64□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.64□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 MFFQ9GZY8 342 aa8.64□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.64□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB9BQ9NP90 201 aa8.64□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.64□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.64□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.64□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 MBD2Q9UBB5 411 aa8.64□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.64□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.64□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 TACC2O95359 2948 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0D9SG52 128 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF212BA8MTL3 300 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 PPIAL4DF5H284 164 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 C19orf84I3L1E1 186 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SIGLEC5O15389 551 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 TNFSF12O43508 249 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 OR2F2O95006 317 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 OR8U9P0C7N5 309 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SELLP14151 372 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 F2RP25116 425 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 S100A11P31949 105 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 EDDM3BP56851 147 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 IL15RAQ13261 267 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 OR2F1Q13607 317 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF345Q14585 488 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 GNMTQ14749 295 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 MSMO1Q15800 293 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFA5Q16718 116 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF695Q8IW36 515 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 MUC15Q8N387 334 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 OR8U1Q8NH10 309 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 LHFPL5Q8TAF8 219 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 IL22RA2Q969J5 263 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 MARVELD3Q96A59 401 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ARL6Q9H0F7 186 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.63□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 NOTCH2Q04721 2471 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RP2O75695 350 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV2-14P01704 120 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 LYL1P12980 280 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 PPOXP50336 477 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 S100A10P60903 97 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ESCO2Q56NI9 601 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DRAM1Q8N682 238 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC35G3Q8N808 338 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RFESDQ8TAC1 157 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DCUN1D4Q92564 292 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CCL17Q92583 94 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SPIN2AQ99865 258 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF126Q9BV68 326 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 OR2D2Q9H210 308 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CALYQ9NYX4 217 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 JPT1Q9UK76 154 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.62□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GW55 424 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 H0YIZ8 118 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 F2RL2O00254 374 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CDS2O95674 445 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SERPINE2P07093 398 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB32Q13637 225 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SMCO1Q147U7 214 aa8.61□□□□□ -1.03
GTPBP1-211ENST00000487538 HFEQ30201 348 aa8.61□□□□□ -1.03
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