RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484806.1

SFI1-223, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-223	ENST00000484806	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	TCF23	Q7RTU1	214 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	FGFRL1	Q8N441	504 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	UBALD1	Q8TB05	177 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	TNFRSF14	Q92956	283 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	UPRT	Q96BW1	309 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	MMP28	Q9H239	520 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	ZNF221	Q9UK13	617 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35	2e-12	■■■■■ 46.8
SFI1-223	ENST00000484806	ITPR2	Q14571	2701 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	TOR1A	O14656	332 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	FCN3	O75636	299 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	IL5	P05113	134 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	MSMB	P08118	114 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	OMG	P23515	440 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	GPR12	P47775	334 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	GZMK	P49863	264 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	PRRX1	P54821	245 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	DLX6	P56179	175 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	RND3	P61587	244 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	CATR1	Q13166	79 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	MORN2	Q502X0	79 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	C4orf46	Q504U0	113 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	ZNF596	Q8TC21	504 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806		Q96MF0	132 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	S1PR3	Q99500	378 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	REG4	Q9BYZ8	158 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	OR2D2	Q9H210	308 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	GPR132	Q9UNW8	380 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	VSIG4	Q9Y279	399 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	MED13L	Q71F56	2210 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806		A0A087X0M5	115 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806		A0A1B0GX30	115 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	HSD17B6	O14756	317 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	RAB29	O14966	203 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	OR8U9	P0C7N5	309 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	SPN	P16150	400 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	PRTN3	P24158	256 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	CD34	P28906	385 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	PIGP	P57054	158 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	LOXL3	P58215	753 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	ARF6	P62330	175 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	SRPX	P78539	464 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	BAMBI	Q13145	260 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	GNMT	Q14749	295 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	TATDN3	Q17R31	274 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	LINC00311	Q8N616	119 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	OR8U1	Q8NH10	309 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	OR9G1	Q8NH87	305 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	PSG11	Q9UQ72	335 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SFI1-223	ENST00000484806	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		6.6	□□□□□ -1.35

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