RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 NBR2O15453 112 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SOX15O60248 233 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 LALBAP00709 142 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 GP9P14770 177 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 OR3A3P47888 321 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SLURP1P55000 103 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR176Q14439 515 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 MORN2Q502X0 79 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ARPC1AQ92747 370 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 GHSRQ92847 366 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 NABP2Q9BQ15 211 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SPATA25Q9BR10 227 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CKLFQ9UBR5 152 aa7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2QL1A1L167 161 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC01619G3V211 115 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 OGG1O15527 345 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CA11O75493 328 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 GPX5O75715 221 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SC5DO75845 299 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FSTP19883 344 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 DCKP27707 260 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ECSCRQ19T08 205 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 LIN54Q6MZP7 749 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 NPBQ8NG41 125 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 RDH12Q96NR8 316 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC29A1Q99808 456 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 BANF2Q9H503 90 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 RETNQ9HD89 108 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 KIAA1456Q9P272 454 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.25□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 TNCP24821 2201 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A087WW49 117 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PPK0 400 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 PDCD6O75340 191 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFA3O95167 84 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 MAS1P04201 325 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 GLAP06280 429 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 OR8U9P0C7N5 309 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 MGMTP16455 207 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FUT3P21217 361 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 HTD2P86397 168 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 Q499Y3 187 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 AWAT2Q6E213 333 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ACSM6Q6P461 480 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 Q96M66 194 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 OR14A2Q96R54 314 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 CST11Q9H112 138 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.24□□□□□ -1.25
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.24□□□□□ -1.25
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