RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 AMY2AP04746 511 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 GNB3P16520 340 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 TGFBR1P36897 503 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 HLA-DRB3P79483 266 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 EBI3Q14213 229 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 ODF3L1Q8IXM7 274 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 LYG1Q8N1E2 194 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 KLHDC1Q8N7A1 406 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 FBN3Q75N90 2809 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 A0A075B6Q4 140 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 AIREO43918 545 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1D-33P01593 117 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1-33P01594 117 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 SCTP09683 121 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 CD3GP09693 182 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 PRR31Q5SQ13 230 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 TMEM11P17152 192 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 HES1Q14469 280 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 HNF4GQ14541 408 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 HERPUD1Q15011 391 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 IZUMO1Q8IYV9 350 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 LGALS14Q8TCE9 139 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 WNT10AQ9GZT5 417 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 IFI27L2Q9H2X8 130 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 MOB4Q9Y3A3 225 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 SERPINE3A8MV23 424 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 TRDCB7Z8K6 153 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 TXNL1O43396 289 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 LANCL1O43813 399 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 FCGR3AP08637 254 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 SMIM18P0DKX4 95 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 VSIG10L2P0DP72 767 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 CD1BP29016 333 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 TMEM95Q3KNT9 176 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 ABCA11PQ4W5N1 156 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 OR2AK2Q8NG84 335 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 OR5H6Q8NGV6 325 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 OR1A1Q9P1Q5 309 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 M0QZK8 103 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 ST8SIA5O15466 376 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 LPLP06858 475 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 CEACAM6P40199 344 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 SCAND1P57086 179 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 LSM3P62310 102 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 CDNFQ49AH0 187 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 IDNKQ5T6J7 187 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 Q8N6K4 173 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 SLC23A1Q9UHI7 598 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 ITGB1BP1O14713 200 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB25P24278 435 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 RPS19P39019 145 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 OR3A3P47888 321 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 OR13F1Q8NGS4 319 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 OR2T10Q8NGZ9 312 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 AGMATQ9BSE5 352 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 FUNDC2Q9BWH2 189 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 RHBDL2Q9NX52 303 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 FABP7O15540 132 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 FGF16O43320 207 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 GSTT2P0CG29 244 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 GSTT2BP0CG30 244 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 ARL6IP1Q15041 203 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 C5orf56Q8N8D9 126 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 C11orf44Q8N8P7 122 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 OR4A4PQ8NGN8 299 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 MAFIPQ8WZ33 124 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A38Q96DW6 304 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 ZNF251Q9BRH9 671 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 ETV7Q9Y603 341 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-211ENST00000480301 HSPA12AO43301 675 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 TMEM127O75204 238 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 SCGNO76038 276 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 LSAMPQ13449 338 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 ARFRP1Q13795 201 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DS1Q14954 304 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 ZNF260Q3ZCT1 412 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-211ENST00000480301 C9orf152Q5JTZ5 239 aa16.64■□□□□ 0.25
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