RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479788.5

DUSP28-204, Transcript of dual specificity phosphatase 28, human

TSL 3

Gene DUSP28, Length 450 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DUSP28-204	ENST00000479788	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	UFD1	Q92890	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788		A0A1W2PPI3	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	RGS10	O43665	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	PDCD6	O75340	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	CA11	O75493	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	HBZ	P02008	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	GLA	P06280	429 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	SRM	P19623	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	MYF6	P23409	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	HTR2C	P28335	458 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	HSPA13	P48723	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	CD83	Q01151	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	SGCD	Q92629	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	TNC	P24821	2201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	SLC31A2	O15432	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	FGF16	O43320	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	TXNL1	O43396	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	RGS11	O94810	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	AMY1A	P04745	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	UCHL1	P09936	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	CD1B	P29016	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	RANBP1	P43487	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	MAP2K4	P45985	399 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	LOXL3	P58215	753 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	SLC35A2	P78381	396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	SLC35B1	P78383	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	IRF3	Q14653	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	P2RY14	Q15391	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	TRAM1	Q15629	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788		Q3ZCU0	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	GALM	Q96C23	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	KCNK15	Q9H427	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP28-204	ENST00000479788	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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