RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475978.1

SH3BP5L-202, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 4,122 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-202ENST00000475978 BMPR1BO00238 502 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 PPIHO43447 177 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 CBR3O75828 277 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 C1orf194Q5T5A4 169 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 Q96M66 194 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZFP30Q9Y2G7 519 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 VAMP5O95183 116 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 THBS3P49746 956 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 GABRA6Q16445 453 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 Q6ZS52 159 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 RBKSQ9H477 322 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 ABI3Q9P2A4 366 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 GAGE10A6NGK3 116 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 CA11O75493 328 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 IGHV4-34P06331 123 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 HOXA6P31267 233 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 FUT6P51993 359 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 SLC38A11Q08AI6 406 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR5D13Q8NGL4 314 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR5B3Q8NH48 314 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 SMIM12Q96EX1 92 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 PPIAL4AQ9Y536 164 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 KIAA1644Q3SXP7 199 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 CYYR1Q96J86 154 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 CACNG5Q9UF02 275 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 SELENOKQ9Y6D0 94 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP5L-202ENST00000475978 GCH1P30793 250 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 BRS3P32247 399 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 EDDM3BP56851 147 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 PCBD1P61457 104 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 SPEM2Q0P670 501 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 MESP1Q9BRJ9 268 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 CCL28Q9NRJ3 127 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 GJE1A6NN92 205 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 CLPSP04118 112 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 LINC00271P0C7V0 271 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 EGR1P18146 543 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 UBALD1Q8TB05 177 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 KCNIP1Q9NZI2 227 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 CLDN16Q9Y5I7 305 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 DOCK11Q5JSL3 2073 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 M0R2Z0 102 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 CIDEAO60543 219 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 BPIFB3P59826 476 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 ICAM4Q14773 271 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 GCNT2Q8N0V5 402 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 FAM89BQ8N5H3 189 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR1F12Q8NHA8 337 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMEM222Q9H0R3 208 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 HTTP42858 3142 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 FBLN7Q53RD9 439 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 MOB3AQ96BX8 217 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 RPRMQ9NS64 109 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 A0A0C4DFX4 3053 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 A0A0U1RQV5 110 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 CEACAM18A8MTB9 384 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 CTXN2P0C2S0 81 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 C1orf185Q5T7R7 199 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMEM164Q5U3C3 297 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 RAB40CQ96S21 281 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMEM204Q9BSN7 226 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 CACNA1HO95180 2353 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 EPOPA6NHQ4 379 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR7C2O60412 319 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZNF32P17041 273 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 PLPPR5Q32ZL2 321 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZXDAP98168 799 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 SNAI3Q3KNW1 292 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 ANKRD37Q7Z713 158 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 NUDT10Q8NFP7 164 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 IMMP2LQ96T52 175 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 NPIPB13A6NJU9 1138 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 NPIPB4C9JG80 1138 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 TNFSF11O14788 317 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 SPINK2P20155 84 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 CBLN1P23435 193 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 NIT1Q86X76 327 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 UCN2Q96RP3 112 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 TM2D1Q9BX74 207 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 SIRPB1O00241 398 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 P04436 131 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 RAB35Q15286 201 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 HIST3H3Q16695 136 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 OR1K1Q8NGR3 316 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 TMEM106BQ9NUM4 274 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP5L-202ENST00000475978 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms