RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	YPEL2	Q96QA6	119 aa		14.24	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		14.24	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	C16orf95	Q9H693	158 aa		14.24	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		14.24	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		14.24	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	ETV7	Q9Y603	341 aa		14.24	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PPI3	338 aa		14.23	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	TRDC	B7Z8K6	153 aa		14.23	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	14.23	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	HNF4G	Q14541	408 aa		14.23	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		14.23	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		14.23	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		14.23	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	14.23	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	14.23	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	FCGR3A	P08637	254 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB25	P24278	435 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	CEACAM6	P40199	344 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	KIR2DS4	P43632	304 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	SCAND1	P57086	179 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	GPR107	Q5VW38	600 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	GPR141	Q7Z602	305 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	DTX3	Q8N9I9	347 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1D-33	P01593	117 aa		14.21	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1-33	P01594	117 aa		14.21	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	TMEM11	P17152	192 aa		14.21	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	FBLN7	Q53RD9	439 aa		14.21	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		14.21	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		14.21	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	CFHR4	Q92496	578 aa		14.21	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	14.21	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	SPATA2	Q9UM82	520 aa		14.21	□□□□□ -0.13
USP19-210	ENST00000465902	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	TMEM235	A6NFC5	223 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	BET1	O15155	118 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ST8SIA5	O15466	376 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	FABP7	O15540	132 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	TXNL1	O43396	289 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	TMEM127	O75204	238 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	PEX14	O75381	377 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	OR2F2	O95006	317 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	GNG2	P59768	71 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	BLCAP	P62952	87 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	KIR2DS1	Q14954	304 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	HACD4	Q5VWC8	232 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	DIABLO	Q9NR28	239 aa		14.2	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	GSTT2	P0CG29	244 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	GSTT2B	P0CG30	244 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	OR3A3	P47888	321 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ZNF137P	P52743	207 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	PROK1	P58294	105 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ZNF702P	Q9H963	129 aa		14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	14.19	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	LANCL1	O43813	399 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	TFAP2A	P05549	437 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ALDH3B2	P48448	385 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	PITPNA	Q00169	270 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	IGSF11	Q5DX21	431 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	S1PR3	Q99500	378 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	GINS4	Q9BRT9	223 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	RNF150	Q9ULK6	438 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		14.18	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		14.17	□□□□□ -0.14
USP19-210	ENST00000465902	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14

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