RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM64CA6NLI5 447 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 OOSP1A8MZH6 123 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 HSD17B6O14756 317 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 YPEL1O60688 119 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 CA11O75493 328 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2F2O95006 317 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1D-33P01593 117 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1-33P01594 117 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 CD36P16671 472 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 EBI3Q14213 229 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf183Q5T699 404 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 Q8N6K4 173 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR10X1Q8NGY0 326 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 SETD6Q8TBK2 473 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 YPEL2Q96QA6 119 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF251Q9BRH9 671 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 Q9N2K0 584 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB18Q9NP72 206 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2S2Q9NQN1 319 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 HSF4Q9ULV5 492 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 A6NHS1 94 aa5.55□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 MFNGO00587 321 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 PDCD5O14737 125 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 SPINT2O43291 252 aa5.55□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-DRB3P79483 266 aa5.55□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.55□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf88Q6PI97 169 aa5.55□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 C8orf31Q8N9H6 132 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8N9W7 124 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10R2Q8NGX6 335 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.55□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 SSR3Q9UNL2 185 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa5.54□□□□□ -1.52
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RABGEF1-206ENST00000461017 CD1BP29016 333 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMD7P51665 324 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 CD83Q01151 205 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 TNP2Q05952 138 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-206ENST00000461017 LSAMPQ13449 338 aa5.54□□□□□ -1.52
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