RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 SULT1A2P50226 295 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 GPM6AP51674 278 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 CTBP2P56545 445 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 RAB38P57729 211 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 RPS14P62263 151 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 RHOBP62745 196 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 PAFAH1B2P68402 229 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 KIR2DS1Q14954 304 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 RPEL1Q2QD12 228 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 PYDC2Q56P42 97 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM97Q5BJF2 176 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 FFAR4Q5NUL3 377 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 TIMM23BQ5SRD1 257 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 PRSS54Q6PEW0 395 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 SPSB3Q6PJ21 355 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 AGTRAPQ6RW13 159 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 ARL9Q6T311 187 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 TOMM20LQ6UXN7 152 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC35E3Q7Z769 313 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRTM1Q86UE6 522 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF547Q8IVP9 402 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 ACOT4Q8N9L9 421 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 PRSS33Q8NF86 280 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 OR52L1Q8NGH7 329 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 OR1J4Q8NGS1 313 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 OR2T35Q8NGX2 323 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 OR6K2Q8NGY2 324 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 ACER1Q8TDN7 264 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 GPER1Q99527 375 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 P2RX4Q99571 388 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 GINS3Q9BRX5 216 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 ANAPC13Q9BS18 74 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 EFCAB11Q9BUY7 163 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 SMIM3Q9BZL3 60 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC25A31Q9H0C2 315 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 OR51J1Q9H342 316 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 PRSS16Q9NQE7 514 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 OR5AC2Q9NZP5 309 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 ERG28Q9UKR5 140 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 TBX21Q9UL17 535 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 ITGB4P16144 1822 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 FRMPD3Q5JV73 1810 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 ADGRB1O14514 1584 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 SCN11AQ9UI33 1791 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 SZT2Q5T011 3432 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 NFAT5O94916 1531 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A0C4DFX4 3053 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM189A5PLL7 270 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 IFITM10A6NMD0 228 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM166BA8MTA8 275 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 HMSDA8MTL9 139 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 E7EQ34 232 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 G3V2L1 256 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 G3V3Q6 166 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 K7EQG2 157 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 M0R2Z0 102 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 CLDN11O75508 207 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 CNMDO75829 334 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 LSM8O95777 96 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 APOA2P02652 100 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 TACSTD2P09758 323 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 SULT1A3P0DMM9 295 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 SULT1A4P0DMN0 295 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 CT45A6P0DMU7 189 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 CT45A5P0DMU8 189 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 CT45A10P0DMU9 189 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 CT45A7P0DMV0 189 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 TCN2P20062 427 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 MIPP30301 263 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 NTSP30990 170 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 SDC2P34741 201 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 KIR2DS4P43632 304 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms