RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 ZBTB34Q8NCN2 500 aa13.44□□□□□ -0.26
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SHQ1-202ENST00000444040 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa13.44□□□□□ -0.26
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SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PRV1 198 aa13.44□□□□□ -0.26
SHQ1-202ENST00000444040 C5orf52A6NGY3 159 aa13.44□□□□□ -0.26
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SHQ1-202ENST00000444040 TFF1P04155 84 aa13.43□□□□□ -0.26
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SHQ1-202ENST00000444040 KHDC3LQ587J8 217 aa13.43□□□□□ -0.26
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SHQ1-202ENST00000444040 IL2RGP31785 369 aa13.42□□□□□ -0.26
SHQ1-202ENST00000444040 BRWD1-AS2P59051 145 aa13.42□□□□□ -0.26
SHQ1-202ENST00000444040 HBG1P69891 147 aa13.42□□□□□ -0.26
SHQ1-202ENST00000444040 HBG2P69892 147 aa13.42□□□□□ -0.26
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF726P1Q15940 193 aa13.42□□□□□ -0.26
SHQ1-202ENST00000444040 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SHQ1-202ENST00000444040 IQCF2Q8IXL9 164 aa13.42□□□□□ -0.26
SHQ1-202ENST00000444040 C12orf57Q99622 126 aa13.42□□□□□ -0.26
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