RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 OR52L2PQ8NGH6 319 aa16.4■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 FAM46BQ96A09 425 aa16.4■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 GALMQ96C23 342 aa16.4■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 NABP2Q9BQ15 211 aa16.4■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 PPIFP30405 207 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 RAB25P57735 213 aa16.39■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 ACSM3Q53FZ2 586 aa16.39■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf100Q5SVJ3 147 aa16.39■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa16.39■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 CYYR1Q96J86 154 aa16.39■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 NEDD4LQ96PU5 975 aa16.39■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 MND1Q9BWT6 205 aa16.39■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 VSIG8P0DPA2 414 aa16.38■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 CD37P11049 281 aa16.38■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 ACTBP60709 375 aa16.38■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 RUNX1Q01196 453 aa16.38■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 GLT8D1Q68CQ7 371 aa16.38■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 LRRTM1Q86UE6 522 aa16.38■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2E2Q96LR5 201 aa16.38■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SULT4A1Q9BR01 284 aa16.38■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 TM2D1Q9BX74 207 aa16.38■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 NBR2O15453 112 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFA3O95167 84 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 CDK1P06493 297 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 MYF6P23409 242 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 LUMP51884 338 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF880Q6PDB4 577 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 NPBQ8NG41 125 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 OR2AK2Q8NG84 335 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 KCNG3Q8TAE7 436 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF251Q9BRH9 671 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM59Q9BXS4 323 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 IFI27L2Q9H2X8 130 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 OR51J1Q9H342 316 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 ABRACLQ9P1F3 81 aa16.37■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 NAPSAO96009 420 aa16.36■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV1-40P01703 118 aa16.36■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 INSL4Q14641 139 aa16.36■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SVOPQ8N4V2 548 aa16.36■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa16.36■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 PIPOXQ9P0Z9 390 aa16.36■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 STEAP1Q9UHE8 339 aa16.36■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A1O15245 554 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V0E1O15342 81 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 UNC119Q13432 240 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf64Q2M2E5 130 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 FAM27D1Q5T7N8 215 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 MOB1BQ7L9L4 216 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf201Q7Z4U5 140 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF491Q8N8L2 437 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 OR11H1Q8NG94 326 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 FAAP24Q9BTP7 215 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD60Q9BZ19 345 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 VCXQ9H320 206 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 GHITMQ9H3K2 345 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SCOCQ9UIL1 159 aa16.35■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM14DPA8MWL7 114 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SEC14L6B5MCN3 397 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 I3L521 148 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 ITGB1BP1O14713 200 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 OR8U8P0C7N1 319 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SRMP19623 302 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 CNTFRP26992 372 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 HTR2CP28335 458 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 OR3A3P47888 321 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 INSL3P51460 131 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 QRFPP83859 136 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 SPHARQ15513 63 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 HSD17B12Q53GQ0 312 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 OR10K2Q6IF99 312 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM65Q6PI78 240 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf24Q7Z6I8 188 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 RITA1Q96K30 269 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 TMED9Q9BVK6 235 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1456Q9P272 454 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 VSIG4Q9Y279 399 aa16.34■□□□□ 0.21
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa16.33■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV41A0A0B4J266 112 aa16.33■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 RAB29O14966 203 aa16.33■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 BPNT1O95861 308 aa16.33■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 UCHL1P09936 223 aa16.33■□□□□ 0.2
LIMS1-208ENST00000428064 C19orf54Q5BKX5 351 aa16.33■□□□□ 0.2
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