RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 PMS2P1A4D2B8 440 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 H0Y980 276 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 DLEU1O43261 78 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 CXCL12P48061 93 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 PYY3Q5JQD4 70 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 GPR146Q96CH1 333 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 GUCD1Q96NT3 240 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 FGF16O43320 207 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 NGFRP08138 427 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MYF5P13349 255 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 NPY1RP25929 384 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 KIR2DS2P43631 304 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TMEM187Q14656 261 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TTC32Q5I0X7 151 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TINAGQ9UJW2 476 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PPE3 182 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 SNAI2O43623 268 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 GALNSP34059 522 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 PRRX1P54821 245 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 ROM1Q03395 351 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 WDYHV1Q96HA8 205 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 SARGQ9BW04 601 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 GDF9O60383 454 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 SCTP09683 121 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 CTGFP29279 349 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 FBLN7Q53RD9 439 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TMEM178AQ8NBL3 297 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 OR10D3Q8NH80 312 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 FZR1Q9UM11 496 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 F5H697 171 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 POU2F2P09086 479 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MAS1LP35410 378 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 NPBWR2P48146 333 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MOB3BQ86TA1 216 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 FOCADQ5VW36 1801 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 M0R1B8 84 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 NDUFS8O00217 210 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MT-CO3P00414 261 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MIC13Q5XKP0 118 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 RNF126Q9BV68 326 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 LY75O60449 1722 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GTI1 187 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 A8MWL6 223 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 M0R296 226 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 SPRY3O43610 288 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 EML2O95834 649 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 LCN2P80188 198 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 SPRED2Q7Z698 418 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 DERL1Q9BUN8 251 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TMEM250H0YL14 139 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 GNG7O60262 68 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 HERVK_113P61574 105 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 NRAPQ86VF7 1730 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 LRRC61Q9BV99 259 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PQD3 144 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 H7C2G1 150 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 NDUFA2O43678 99 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 ORM1P02763 201 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 IL11P20809 199 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 ARF6P62330 175 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 LRRC29Q8WV35 223 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms