RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 A0A1W2PQM1 296 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNFSF13O75888 250 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 NUDT8Q8WV74 236 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 CSTL1Q9H114 145 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM160Q9NX00 188 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 GPR179Q6PRD1 2367 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRACP01848 142 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDKN1BP46527 198 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 LCN2P80188 198 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 B4GALNT1Q00973 533 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 TTC9BQ8N6N2 239 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 OR4P4Q8NGL7 312 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 RND1Q92730 232 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 PTX4Q96A99 478 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM126AQ9H061 195 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 CCL27Q9Y4X3 112 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 M0R135 149 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDC14BO60729 498 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 NDUFB4O95168 129 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 GJB5O95377 273 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 CEACAM6P40199 344 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 C2orf27AQ580R0 203 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 C12orf73Q69YU5 71 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF788Q6ZQV5 615 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF799Q96GE5 643 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 RAB1BQ9H0U4 201 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 MMP25Q9NPA2 562 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 TFPI2P48307 235 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 HYAL1Q12794 435 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 VAX1Q5SQQ9 334 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 MRGPREQ86SM8 312 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 OR52N5Q8NH56 324 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM45BQ96B21 275 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF665Q9H7R5 613 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 BRCA2P51587 3418 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDC14CA4D256 554 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF205O95201 554 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF137PP52743 207 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 EFNB1P98172 346 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 PRNTQ86SH4 94 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 Q8IYB0 196 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 PIANPQ8IYJ0 282 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 OR4D9Q8NGE8 314 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 KCNE4Q8WWG9 221 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 SCAMP4Q969E2 229 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 HARBI1Q96MB7 349 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF391Q9UJN7 358 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 ITGB1BP1O14713 200 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZFAND5O76080 213 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 PF4V1P10720 104 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 VDAC1P21796 283 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 ERVK11-1P61568 191 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 FUT5Q11128 374 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 INSL4Q14641 139 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 KISS1Q15726 138 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 SPSB1Q96BD6 273 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 TM4SF18Q96CE8 201 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 CLN8Q9UBY8 286 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 VENTXO95231 258 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 MDKP21741 143 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 RABIFP47224 123 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 NTHL1P78549 312 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 GGTLC2Q14390 218 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 TGIF1Q15583 401 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 TEPPQ6URK8 271 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 MUCL1Q96DR8 90 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 LPAR2Q9HBW0 351 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 VSIG4Q9Y279 399 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 PCSK5Q92824 1860 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 MPDU1O75352 247 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNFRSF6BO95407 300 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 PSG1P11464 419 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 DRD1P21728 446 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZXDAP98168 799 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 PRSS8Q16651 343 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 C10orf128Q5T292 105 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 MED25Q71SY5 747 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 RTN4RL2Q86UN3 420 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRZ1-201ENST00000393386 HIST1H2BKO60814 126 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms