RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 OR2G3Q8NGZ4 309 aa20.11■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 FAM213BQ8TBF2 198 aa20.11■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 NINJ1Q92982 152 aa20.11■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 METRNQ9UJH8 293 aa20.11■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 PRR14LQ5THK1 2151 aa20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 KRBOX4Q5JUW0 171 aa20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 ALKBH2Q6NS38 261 aa20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 ZBTB34Q8NCN2 500 aa20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 OR52L2PQ8NGH6 319 aa20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 MRGPRDQ8TDS7 321 aa20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 ATP5SQ99766 215 aa20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 OR2D2Q9H210 308 aa20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 UMAD1C9J7I0 102 aa20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 NPBWR1P48145 328 aa20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 MSMPQ1L6U9 139 aa20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF292O60281 2723 aa20.1■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 K7EM74 188 aa20.09■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 TXNL1O43396 289 aa20.09■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM88Q6PEY1 159 aa20.09■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 TOLLIPQ9H0E2 274 aa20.09■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 DUSP13Q9UII6 198 aa20.09■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 WSB1Q9Y6I7 421 aa20.09■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.09■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 H3BP45 60 aa20.09■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 TIMP3P35625 211 aa20.09■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 PEA15Q15121 130 aa20.09■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 GUK1Q16774 197 aa20.09■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TRIM54-201ENST00000296098 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 SYNGR2O43760 224 aa20.08■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 GLIPR1P48060 266 aa20.08■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 SULT1A1P50225 295 aa20.08■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 LRP11Q86VZ4 500 aa20.08■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 RNF150Q9ULK6 438 aa20.08■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa20.08■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 CRYAAP02489 173 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 PPT1P50897 306 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 C3orf36Q3SXR2 165 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 CBLN2Q8IUK8 224 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 CD177Q8N6Q3 437 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 LFNGQ8NES3 379 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 OR13A1Q8NGR1 328 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 MUCL1Q96DR8 90 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 LURAP1Q96LR2 239 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 SFXN3Q9BWM7 321 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 RFNGQ9Y644 331 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 KPTNQ9Y664 436 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 DFFBO76075 338 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 EGR1P18146 543 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 TPRX1Q8N7U7 411 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 OR10Z1Q8NGY1 313 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 C5orf30Q96GV9 206 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 SCRT1Q9BWW7 348 aa20.07■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 SVILO95425 2214 aa20.06■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 SRRM5B3KS81 715 aa20.06■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 IGHV3-13P01766 116 aa20.06■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 SSTR5P35346 364 aa20.06■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 PAX5Q02548 391 aa20.06■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 MSMO1Q15800 293 aa20.06■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 TRAT1Q6PIZ9 186 aa20.06■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 TOR1AO14656 332 aa20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 IAPPP10997 89 aa20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 PRDX2P32119 198 aa20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 CATR1Q13166 79 aa20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 PBDC1Q9BVG4 233 aa20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 MMP24Q9Y5R2 645 aa20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 RUNX1Q01196 453 aa20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 KRTCAP3Q53RY4 240 aa20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 FAM90A1Q86YD7 464 aa20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 FGFRL1Q8N441 504 aa20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 FAM57AQ8TBR7 257 aa20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa20.05■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 GLRXP35754 106 aa20.04■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 SMUG1Q53HV7 270 aa20.04■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 COA4Q9NYJ1 87 aa20.04■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 PSENENQ9NZ42 101 aa20.04■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 RAMP3O60896 148 aa20.03■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF737O75373 536 aa20.03■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 RPL30P62888 115 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 EDDM3AQ14507 147 aa20.03■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 FAM180AQ6UWF9 173 aa20.03■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 OR2V2Q96R30 315 aa20.03■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 A0A1B0GV50 99 aa20.03■□□□□ 0.8
TRIM54-201ENST00000296098 SPINT2O43291 252 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms