RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 LY6LH3BQJ8 138 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 SLC31A2O15432 143 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 HSPA12AO43301 675 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 ETV6P41212 452 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF137PP52743 207 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 IL18Q14116 193 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 CT45A1Q5HYN5 189 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 OR10J5Q8NHC4 309 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 CT45A3Q8NHU0 189 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 C17orf50Q8WW18 174 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 EDARADDQ8WWZ3 215 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 MEGF9Q9H1U4 602 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 ZNRD1Q9P1U0 126 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 FAM96BQ9Y3D0 163 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 V9GYH0 126 aa10.72□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PPE3 182 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 FABP12A6NFH5 140 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 GABARAPH6UMI1 98 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 RCVRNP35243 200 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 CEACAM3P40198 252 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 CEACAM6P40199 344 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 AANATQ16613 207 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 Q6YL49 198 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00299Q6ZSB3 139 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 OR2AK2Q8NG84 335 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 OR5AP2Q8NGF4 316 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 OR10X1Q8NGY0 326 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 OR52I2Q8NH67 350 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 FAM216AQ8WUB2 273 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 SMIM4Q8WVI0 70 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 IFI27L2Q9H2X8 130 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 RDH8Q9NYR8 311 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 MTFP1Q9UDX5 166 aa10.71□□□□□ -0.69
CCDC42-201ENST00000293845 C2CD3Q4AC94 2353 aa10.71□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 CUBNO60494 3623 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0A6YYJ9 748 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 VGLL3A8MV65 326 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 OOSP1A8MZH6 123 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 BET1O15155 118 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 IL3RAP26951 378 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 RAB7AP51149 207 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 ARPC4P59998 168 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 HILS1P60008 231 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 ACTBP60709 375 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 ACTG1P63261 375 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 FAM131AQ6UXB0 335 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 DYNAPQ8N1N2 210 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 AGMATQ9BSE5 352 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 GHITMQ9H3K2 345 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 OCEL1Q9H607 264 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 PTTG2Q9NZH5 202 aa10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 RBBP9O75884 186 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 IFNA2P01563 188 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 FCER2P06734 321 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 DYNLT3P51808 116 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 TAS2R46P59540 309 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 DGCR2P98153 550 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 CDK10Q15131 360 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF79Q15937 498 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 SSX2Q16385 188 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 SPANXN2Q5MJ10 180 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 LYSMD2Q8IV50 215 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 FCAMRQ8WWV6 532 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 RPEQ96AT9 228 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 GINS4Q9BRT9 223 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 NECAP2Q9NVZ3 263 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 KLK11Q9UBX7 282 aa10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 HSD17B6O14756 317 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 ST8SIA5O15466 376 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 TCF21O43680 179 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 TUSC2O75896 110 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 IER3P46695 156 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 FAM71F2Q6NXP2 309 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 OVCH2Q7RTZ1 564 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 LYG1Q8N1E2 194 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM86BQ8N661 226 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 SSMEM1Q8WWF3 244 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 TOMM40LQ969M1 308 aa10.68□□□□□ -0.7
CCDC42-201ENST00000293845 JMJD8Q96S16 334 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.9 ms