RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260356.5

THBS1-201, Transcript of thrombospondin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS1, Length 7,775 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1-201ENST00000260356 WFDC3Q8IUB2 231 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 PATE4P0C8F1 98 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 COMPP49747 757 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 RPL31P62899 125 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 LYZL2Q7Z4W2 148 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 CACNA1HO95180 2353 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 K7N7A8 449 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 SOX8P57073 446 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 SPATA45Q537H7 98 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 WDR34Q96EX3 536 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 MPLP40238 635 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 MYEOVQ96EZ4 313 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 CCL28Q9NRJ3 127 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 UQCR10Q9UDW1 63 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 A0A1W2PRD5 423 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 A0A1W2PRF3 423 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 A0A1W2PRM7 423 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 LINC00862A6NCI5 91 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 ECSCRQ19T08 205 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 HSPB9Q9BQS6 159 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 TMEM30AQ9NV96 361 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 PTPRDP23468 1912 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 TMEM189A5PLL7 270 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 KBTBD11O94819 623 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 WNT9BO14905 357 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 SELENOTP62341 195 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 MMDQ15546 238 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 PIGYQ3MUY2 71 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 TXNDC17Q9BRA2 123 aa10□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 LIPT2A6NK58 231 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 CEACAM18A8MTB9 384 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 CBLN3Q6UW01 205 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 EDIL3O43854 480 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 IGF2P01344 180 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 KLRB1Q12918 225 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 OR1K1Q8NGR3 316 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 SCNM1Q9BWG6 230 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 GBF1Q92538 1859 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 EMP1P54849 157 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 PLPPR5Q32ZL2 321 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 P2RX4Q99571 388 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 RASL10BQ96S79 203 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 GPA33Q99795 319 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 CHST5Q9GZS9 411 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 A0A1W2PQD3 144 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 HLA-DQA1P01909 254 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 BCL2P10415 239 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 ATP6V0CP27449 155 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 NAAAQ02083 359 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 PSG2P11465 335 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 PRR13Q9NZ81 148 aa9.99□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 C21orf140B9A014 251 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 J3QT63 122 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 LEPROTL1O95214 131 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 LOXL3P58215 753 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 SLC35B1P78383 322 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 LHFPL5Q8TAF8 219 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 DDB2Q92466 427 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 PPP1R17O96001 155 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 ERVFRD-1P60508 538 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 AMER3Q8N944 861 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 PRR7Q8TB68 274 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 GUCD1Q96NT3 240 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 CXCL10P02778 98 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 TNCP24821 2201 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 RNFT1Q5M7Z0 435 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 LHX9Q9NQ69 397 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 ABCA3Q99758 1704 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 OR10AC1Q8NH08 325 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 GALNT14Q96FL9 552 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.98□□□□□ -0.81
THBS1-201ENST00000260356 ZNF205O95201 554 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms