RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637239.2

TCF4-285, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 7,771 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-285	ENST00000637239	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239		M0QZK8	103 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	ATP6V1F	Q16864	119 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	FAM209B	Q5JX69	171 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	ZG16B	Q96DA0	208 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	GP6	Q9HCN6	339 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239		A0A087X0M5	115 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239		A0A1B0GX30	115 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	S1PR2	O95136	353 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	PGA3	P0DJD8	388 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	MPV17L	Q2QL34	196 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	LINC00303	Q3SY05	128 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	YIPF6	Q96EC8	236 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	BCL2L11	O43521	198 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	GNG4	P50150	75 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	HERVK_113	P61574	105 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	CT62	P0C5K7	136 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	NHLH1	Q02575	133 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	NHLH2	Q02577	135 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	NPAS1	Q99742	590 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	RNF122	Q9H9V4	155 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	SLC17A2	O00624	439 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	EREG	O14944	169 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	MARVELD3	Q96A59	401 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	RAB40C	Q96S21	281 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	PRSS50	Q9UI38	385 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239		A0A1W2PNV4	684 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	DEDD	O75618	318 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	SSX1	Q16384	188 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	GUK1	Q16774	197 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	BAP18	Q8IXM2	172 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	PIEZO1	Q92508	2521 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	HSBP1	O75506	76 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	CSF2RB	P32927	897 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	ARF6	P62330	175 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	CEBPE	Q15744	281 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	WDR38	Q5JTN6	314 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	VGLL1	Q99990	258 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	IL17B	Q9UHF5	180 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	RNF114	Q9Y508	228 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	NEURL1	O76050	574 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	SFTA3	P0C7M3	94 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	SMIM6	P0DI80	62 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	KHDC3L	Q587J8	217 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	VWA1	Q6PCB0	445 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	ZNF429	Q86V71	674 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	UCN2	Q96RP3	112 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	CACNA1D	Q01668	2161 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	MGST3	O14880	152 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	SYNGR1	O43759	233 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239		M0R143	59 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	RGS13	O14921	159 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	CIDEA	O60543	219 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	DTX2	Q86UW9	622 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TCF4-285	ENST00000637239	OR8G5	Q8NG78	346 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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