RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZN92	141 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RTL4	Q6ZR62	310 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SSX7	Q7RTT5	188 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF550	Q7Z398	422 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM54	Q969K7	222 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP19	Q96LK0	163 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ATF6B	Q99941	703 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MED31	Q9Y3C7	131 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ACACA	Q13085	2346 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GVI7	797 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FUOM	A2VDF0	154 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC42EP2	O14613	210 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CDRT1	O95170	752 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CRYAA	P02489	173 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CTXN2	P0C2S0	81 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PLA2G2A	P14555	144 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CCKAR	P32238	428 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMD7	P51665	324 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CTBP2	P56545	445 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	BTG2	P78543	158 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IFITM3	Q01628	133 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF141	Q15928	474 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZT83	130 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GID4	Q8IVV7	300 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF614	Q8N883	585 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NUP37	Q8NFH4	326 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ARPC1A	Q92747	370 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35B4	Q969S0	331 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM203	Q969S6	136 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF488	Q96MN9	340 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	KCTD7	Q96MP8	289 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IP6K3	Q96PC2	410 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR52D1	Q9H346	318 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0B4J2E0	115 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GWA3	101 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GX12	115 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		C9J4A7	227 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GABRP	O00591	440 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RGS5	O15539	181 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CHP2	O43745	196 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	UPK1B	O75841	260 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNG	P01579	166 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1D-16	P01601	117 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	HLA-DPB1	P04440	258 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	LIMS3	P0CW19	117 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	LIMS4	P0CW20	117 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	COX5B	P10606	129 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TCN2	P20062	427 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV1-2	P23083	117 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ETV6	P41212	452 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR2DS2	P43631	304 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2E1	P51965	193 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10A3	P58181	314 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFA1	P59665	94 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFA3	P59666	94 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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