RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	CUBN	O60494	3623 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ODAM	A1E959	279 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	C9orf170	A2RU37	121 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	OVOL3	O00110	214 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	NDUFS7	O75251	213 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CCNK	O75909	580 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	DIRAS3	O95661	229 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	LY6G6D	O95868	133 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	IGHV2-70	P01814	119 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	HBZ	P02008	142 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CXCL3	P19876	107 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	GLP1R	P43220	463 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	P2RX3	P56373	397 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	FXYD4	P59646	89 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	IL13RA1	P78552	427 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	DHRS2	Q13268	280 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	PPP1R1A	Q13522	171 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	EDDM3A	Q14507	147 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	HFE	Q30201	348 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	LYG2	Q86SG7	212 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	AKAP14	Q86UN6	197 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	MED28	Q9H204	178 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	F2RL2	O00254	374 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF728	P0DKX0	622 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	PGAM2	P15259	253 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	AKR1C4	P17516	323 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	GNRHR	P30968	328 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SSTR5	P35346	364 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CDKN1A	P38936	164 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ECI1	P42126	302 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	TAS2R31	P59538	309 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CD83	Q01151	205 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	GNMT	Q14749	295 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	C4orf46	Q504U0	113 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	C6orf183	Q5T699	404 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SPIC	Q8N5J4	248 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CORO2A	Q92828	525 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	TOMM40L	Q969M1	308 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF69	Q9UC07	566 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	OPN4	Q9UHM6	478 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	DBX1	A6NMT0	343 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916		G3V3Q6	166 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	TMPRSS2	O15393	492 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ADAM20	O43506	726 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SSNA1	O43805	119 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	OR2A4	O95047	310 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SFT2D2	O95562	160 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	IGLV2-14	P01704	120 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	DAO	P14920	347 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	GZMH	P20718	246 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	EDDM3B	P56851	147 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	PIGP	P57054	158 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	LOXL3	P58215	753 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	HERV-K104	P61576	105 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	RND3	P61587	244 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		6.05	□□□□□ -1.44

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