RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-215	ENST00000589825	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	SVOP	Q8N4V2	548 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	GALM	Q96C23	342 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	R3HDM4	Q96D70	268 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	TM2D1	Q9BX74	207 aa		12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	PDCD5	O14737	125 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	FGF16	O43320	207 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	OPN1MW	P04001	364 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	FABP5	Q01469	135 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	P2RY14	Q15391	338 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	STEAP3	Q658P3	488 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	SETD6	Q8TBK2	473 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	NICN1	Q9BSH3	213 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	KCNK15	Q9H427	330 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	JPT1	Q9UK76	154 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825		V9GY05	133 aa		12.82	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	CD37	P11049	281 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	MYL9	P24844	172 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	GABARAPL2	P60520	117 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	UNC119	Q13432	240 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	MORN2	Q502X0	79 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	FBLN7	Q53RD9	439 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		12.81	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A1W2PRX2	142 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC31A2	O15432	143 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	WIPF1	O43516	503 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	AMY1A	P04745	511 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	AMY2A	P04746	511 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	CD1B	P29016	333 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	HTD2	P86397	168 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		12.8	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	PSMB11	A5LHX3	300 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	SERPINE3	A8MV23	424 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	YPEL1	O60688	119 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	MOS	P00540	346 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	PF4V1	P10720	104 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF134	P52741	427 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	QRFP	P83859	136 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	CD83	Q01151	205 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	EBI3	Q14213	229 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	YPEL2	Q96QA6	119 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	SOCS1	O15524	211 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	KCNAB3	O43448	404 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	VEGFC	P49767	419 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF137P	P52743	207 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	CLDN12	P56749	244 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC35B1	P78383	322 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	SSX1	Q16384	188 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	HES5	Q5TA89	166 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	C1QL4	Q86Z23	238 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	GFI1	Q99684	422 aa		12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
EFTUD2-215	ENST00000589825	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		12.78	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms