RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 ARL11Q969Q4 196 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 AKR1E2Q96JD6 320 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB9BQ9NP90 201 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 CCL28Q9NRJ3 127 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 DUX4Q9UBX2 424 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PKDREJQ9NTG1 2253 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 F2RL2O00254 374 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 SOD3P08294 240 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 DNASE1P24855 282 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
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CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00574Q9H8X3 128 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 RP2O75695 350 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 SSTR5P35346 364 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
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CAPNS1-207ENST00000589146 OR11H4Q8NGC9 324 aa18.9■□□□□ 0.62
CAPNS1-207ENST00000589146 OR52L2PQ8NGH6 319 aa18.9■□□□□ 0.62
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CAPNS1-207ENST00000589146 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 Q5BKY6 102 aa18.89■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 LIAT1Q6ZQX7 453 aa18.89■□□□□ 0.61
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CAPNS1-207ENST00000589146 C17orf58Q2M2W7 97 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM30BQ3MIR4 351 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 GSG1LQ6UXU4 331 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D26Q86UD7 250 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB34Q8NCN2 500 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 GLYATL2Q8WU03 294 aa18.88■□□□□ 0.61
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CAPNS1-207ENST00000589146 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
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CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM246Q9BRR3 403 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 CALYQ9NYX4 217 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR13Q9NZ81 148 aa18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 CCSO14618 274 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 SNAPC5O75971 98 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV2-70P01814 119 aa18.87■□□□□ 0.61
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CAPNS1-207ENST00000589146 CLN8Q9UBY8 286 aa18.87■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
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CAPNS1-207ENST00000589146 ABCA4P78363 2273 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 DSCAML1Q8TD84 2053 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 hADV38S2A0JD32 116 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGB1BP1O14713 200 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAM20O43506 726 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 YPEL1O60688 119 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 FCN3O75636 299 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 LOXL3P58215 753 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 CYCSP99999 105 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 GNMTQ14749 295 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 LYPD2Q6UXB3 125 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 LGI3Q8N145 548 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 C9orf62Q8N4C0 152 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM56Q96MV1 263 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 YPEL2Q96QA6 119 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TP53RKQ96S44 253 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM222Q9H0R3 208 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TAS2R3Q9NYW6 316 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00312Q9Y6C7 94 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM208BQ5VWN6 2430 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFB3O43676 98 aa18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAP1O75689 374 aa18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8U9P0C7N5 309 aa18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 FGL1Q08830 312 aa18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 SP6Q3SY56 376 aa18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC10Q5BKY1 277 aa18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF645Q8N7E2 425 aa18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8U1Q8NH10 309 aa18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 RFESDQ8TAC1 157 aa18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 PDCD10Q9BUL8 212 aa18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa18.84■□□□□ 0.61
CAPNS1-207ENST00000589146 HMSDA8MTL9 139 aa18.84■□□□□ 0.61
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