RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 OR5R1Q8NH85 324 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 FBXO7Q9Y3I1 522 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ZNF724A8MTY0 619 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 NXPH2O95156 264 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 MT-CO3P00414 261 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-205ENST00000587860 ALDH3B1P43353 468 aa12.9□□□□□ -0.34
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CTIF-205ENST00000587860 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
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CTIF-205ENST00000587860 IL1F10Q8WWZ1 152 aa12.89□□□□□ -0.35
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CTIF-205ENST00000587860 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CTIF-205ENST00000587860 KALRNO60229 2985 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-205ENST00000587860 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CTIF-205ENST00000587860 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-205ENST00000587860 IGKV1-13P0DP09 117 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-205ENST00000587860 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CTIF-205ENST00000587860 SH3BGRL3Q9H299 93 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-205ENST00000587860 TMEM210A6NLX4 147 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-205ENST00000587860 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-205ENST00000587860 NKX2-8O15522 239 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-205ENST00000587860 IFNA21P01568 189 aa12.86□□□□□ -0.35
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