RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R3Q9NYW6 316 aa21.44■■□□□ 1.02
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CAPNS1-204ENST00000587718 GPR137BO60478 399 aa21.43■■□□□ 1.02
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CAPNS1-204ENST00000587718 KCNAB3O43448 404 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 VDAC1P21796 283 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa21.37■■□□□ 1.01
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