RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575313.1

CLDN7-208, Transcript of claudin 7, humanhuman

TSL 3

Gene CLDN7, Length 605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7-208ENST00000575313 ARL11Q969Q4 196 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 JMJD8Q96S16 334 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 CALYQ9NYX4 217 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 C15orf65H3BRN8 121 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 SCTP09683 121 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 NAT1P18440 290 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 GDNFP39905 211 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 KIR2DS4P43632 304 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 ACTBP60709 375 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 ACTG1P63261 375 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 HLA-DRB3P79483 266 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 KIR2DS1Q14954 304 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 HMGN3Q15651 99 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 OR52W1Q6IF63 320 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 PDZD9Q8IXQ8 264 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 RFESDQ8TAC1 157 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 UBALD1Q8TB05 177 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 SNAPC3Q92966 411 aa14.59□□□□□ -0.07
CLDN7-208ENST00000575313 DSCAML1Q8TD84 2053 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 SPINT2O43291 252 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 HBZP02008 142 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 GSTT2P0CG29 244 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 GSTT2BP0CG30 244 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 IGHV1-8P0DP01 117 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 SSTR5P35346 364 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 HILS1P60008 231 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 KLRD1Q13241 179 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 PRR18Q8N4B5 295 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 OR1L1Q8NH94 360 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 TRIM63Q969Q1 353 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 CCDC32Q9BV29 185 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 NPFFO15130 113 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 FABP7O15540 132 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 HLA-DMAP28067 261 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 DLX1P56177 255 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 RAB9BQ9NP90 201 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 SESN1Q9Y6P5 492 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 CSF1P09603 554 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 IL7P13232 177 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 OMGP23515 440 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 ARPC4P59998 168 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 MIDNQ504T8 468 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 TRIQKQ629K1 86 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 HCP5Q6MZN7 132 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 GALMQ96C23 342 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 KIRREL1Q96J84 757 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 F2RL2O00254 374 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 MMP23AO75900 390 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 PMP2P02689 132 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 CD3DP04234 171 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 COX7A1P24310 79 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 SAA4P35542 130 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 OR3A3P47888 321 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 INPP1P49441 399 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 TAS2R19P59542 299 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 LTC4SQ16873 150 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 IGSF11Q5DX21 431 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 PNKDQ8N490 385 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 A0A0U1RQK1 487 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 A0A1W2PRD5 423 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN7-208ENST00000575313 A0A1W2PRF3 423 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms