RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 NANOGP1Q8N7R0 232 aa13.12□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa13.12□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 GALMQ96C23 342 aa13.12□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 Q96M66 194 aa13.12□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 S1PR3Q99500 378 aa13.12□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 BANF2Q9H503 90 aa13.12□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 TAF9BQ9HBM6 251 aa13.12□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 SCN3BQ9NY72 215 aa13.12□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF581Q9P0T4 197 aa13.12□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ABRACLQ9P1F3 81 aa13.12□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 JPT1Q9UK76 154 aa13.12□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 MAGEA13PA6NCF6 341 aa13.11□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 LANCL1O43813 399 aa13.11□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 HTD2P86397 168 aa13.11□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 FOXE3Q13461 319 aa13.11□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 DEFB121Q5J5C9 76 aa13.11□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 RNLSQ5VYX0 342 aa13.11□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 Q8N6K4 173 aa13.11□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 OR10V1Q8NGI7 309 aa13.11□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 OR8U1Q8NH10 309 aa13.11□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 UBALD1Q8TB05 177 aa13.11□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 PHYHIPQ92561 330 aa13.11□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 TFAP2CQ92754 450 aa13.11□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 UBE2QL1A1L167 161 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ERICH4A6NGS2 130 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 H0YHG0 523 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ACSM3Q53FZ2 586 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 C8orf86Q6ZUL3 223 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 Q8N9W7 124 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF439Q8NDP4 499 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM104Q8NE00 496 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 KCNG3Q8TAE7 436 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 STEAP1Q9UHE8 339 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 LINC00527Q9UJ94 153 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF580Q9UK33 172 aa13.1□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 YPEL1O60688 119 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 BPNT1O95861 308 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 MORN2Q502X0 79 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 CT45A1Q5HYN5 189 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 NKAPLQ5M9Q1 402 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 LY6G6FQ5SQ64 297 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 OR2AK2Q8NG84 335 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 OR1L1Q8NH94 360 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 CT45A3Q8NHU0 189 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 FBLIM1Q8WUP2 373 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 FAM46BQ96A09 425 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 YPEL2Q96QA6 119 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM59Q9BXS4 323 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 GHITMQ9H3K2 345 aa13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SPNS1-211ENST00000568829 CCL24O00175 119 aa13.08□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 RAMP3O60896 148 aa13.08□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 CDK1P06493 297 aa13.08□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 GNAO1P09471 354 aa13.08□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 MMDQ15546 238 aa13.08□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 HSD17B12Q53GQ0 312 aa13.08□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 OR5M8Q8NGP6 311 aa13.08□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 P2RX4Q99571 388 aa13.08□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF251Q9BRH9 671 aa13.08□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA1456Q9P272 454 aa13.08□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 MGAT4AQ9UM21 535 aa13.08□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 SLC31A2O15432 143 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 IGF1P05019 195 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 SRMP19623 302 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF134P52741 427 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 RAB25P57735 213 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 LSAMPQ13449 338 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 KIR2DS1Q14954 304 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 SPHARQ15513 63 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 TRAM1Q15629 374 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 FAM71F2Q6NXP2 309 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM65Q6PI78 240 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 ETV3LQ6ZN32 361 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 MOB1BQ7L9L4 216 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 LYPD6Q86Y78 171 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 RNF152Q8N8N0 203 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 UFD1Q92890 307 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 TMED9Q9BVK6 235 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 DCLRE1BQ9H816 532 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 PLSCR3Q9NRY6 295 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 FKBP14Q9NWM8 211 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 PIPOXQ9P0Z9 390 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 TPRKBQ9Y3C4 175 aa13.07□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 PTGES3LE9PB15 166 aa13.06□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 K7EIL1 84 aa13.06□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 IGHG4P01861 327 aa13.06□□□□□ -0.32
SPNS1-211ENST00000568829 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.5 ms