RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 INSL4Q14641 139 aa16.52■□□□□ 0.24
PPP4C-211ENST00000567642 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.52■□□□□ 0.24
PPP4C-211ENST00000567642 SIGIRRQ6IA17 410 aa16.52■□□□□ 0.24
PPP4C-211ENST00000567642 ETV3LQ6ZN32 361 aa16.52■□□□□ 0.24
PPP4C-211ENST00000567642 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PPP4C-211ENST00000567642 GAPTQ8N292 157 aa16.52■□□□□ 0.24
PPP4C-211ENST00000567642 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PPP4C-211ENST00000567642 TMED9Q9BVK6 235 aa16.52■□□□□ 0.24
PPP4C-211ENST00000567642 MND1Q9BWT6 205 aa16.52■□□□□ 0.24
PPP4C-211ENST00000567642 CST11Q9H112 138 aa16.52■□□□□ 0.24
PPP4C-211ENST00000567642 OR2S2Q9NQN1 319 aa16.52■□□□□ 0.24
PPP4C-211ENST00000567642 FKBP14Q9NWM8 211 aa16.52■□□□□ 0.24
PPP4C-211ENST00000567642 GHRLQ9UBU3 117 aa16.52■□□□□ 0.24
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD65E5RJM6 399 aa16.51■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 PTGES3LE9PB15 166 aa16.51■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 SC5DO75845 299 aa16.51■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 CDK1P06493 297 aa16.51■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 THBS3P49746 956 aa16.51■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 FAM27D1Q5T7N8 215 aa16.51■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 TEX38Q6PEX7 206 aa16.51■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 DPF1Q92782 380 aa16.51■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 S1PR3Q99500 378 aa16.51■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 H0YHG0 523 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF137PP52743 207 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 GNMTQ14749 295 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 MORN2Q502X0 79 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 GLT8D1Q68CQ7 371 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 OR10K2Q6IF99 312 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 C5orf24Q7Z6I8 188 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 MS4A15Q8N5U1 240 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 OR52L2PQ8NGH6 319 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 NEDD4LQ96PU5 975 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 GON7Q9BXV9 100 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 GPR61Q9BZJ8 451 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 PLSCR3Q9NRY6 295 aa16.5■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 K7EIL1 84 aa16.49■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 UBBP0CG47 229 aa16.49■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 MYCNOSP40205 109 aa16.49■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 F2RL1P55085 397 aa16.49■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 KRTAP10-11P60412 298 aa16.49■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa16.49■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 DEFB121Q5J5C9 76 aa16.49■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF695Q8IW36 515 aa16.49■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 OR8H1Q8NGG4 311 aa16.49■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 SCN3BQ9NY72 215 aa16.49■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 LANCL1O43813 399 aa16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 RRP9O43818 475 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 SLC6A1P30531 599 aa16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 GP2P55259 537 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 RAB25P57735 213 aa16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 MED22Q15528 200 aa16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 C6orf141Q5SZD1 244 aa16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 STEAP3Q658P3 488 aa16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 LCNL1Q6ZST4 164 aa16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 CEACAM19Q7Z692 300 aa16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 LRRTM1Q86UE6 522 aa16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 DUX3Q96PT4 197 aa16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 SULT4A1Q9BR01 284 aa16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 JPT1Q9UK76 154 aa16.48■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa16.47■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 VSIG8P0DPA2 414 aa16.47■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 SOX6P35712 828 aa16.47■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 LSAMPQ13449 338 aa16.47■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 SPHARQ15513 63 aa16.47■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 RNLSQ5VYX0 342 aa16.47■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.47■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 HSPB9Q9BQS6 159 aa16.47■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 FAAP24Q9BTP7 215 aa16.47■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM59Q9BXS4 323 aa16.47■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 KCNK15Q9H427 330 aa16.47■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 RGS11O94810 467 aa16.46■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 VDAC1P21796 283 aa16.46■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 MYF6P23409 242 aa16.46■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 CHATP28329 748 aa16.46■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 HSD17B12Q53GQ0 312 aa16.46■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 C6orf201Q7Z4U5 140 aa16.46■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.46■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 PHYHIPQ92561 330 aa16.46■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 GALMQ96C23 342 aa16.46■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 DCLRE1BQ9H816 532 aa16.46■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
PPP4C-211ENST00000567642 SRMP19623 302 aa16.45■□□□□ 0.22
PPP4C-211ENST00000567642 HTR2CP28335 458 aa16.45■□□□□ 0.22
PPP4C-211ENST00000567642 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PPP4C-211ENST00000567642 HTD2P86397 168 aa16.45■□□□□ 0.22
PPP4C-211ENST00000567642 MMDQ15546 238 aa16.45■□□□□ 0.22
PPP4C-211ENST00000567642 C1orf100Q5SVJ3 147 aa16.45■□□□□ 0.22
PPP4C-211ENST00000567642 KCNG3Q8TAE7 436 aa16.45■□□□□ 0.22
PPP4C-211ENST00000567642 SETD6Q8TBK2 473 aa16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms