RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567542.5

PRMT7-223, Transcript of protein arginine methyltransferase 7, human

TSL 1 (best)

Gene PRMT7, Length 3,542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT7-223	ENST00000567542	ZNF709	Q8N972	641 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	POM121	Q96HA1	1249 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	ARV1	Q9H2C2	271 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SLC22A20	A6NK97	555 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SYNGR3	O43761	229 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	IL24	Q13007	206 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	HES3	Q5TGS1	186 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	RNF150	Q9ULK6	438 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	BAX	Q07812	192 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SDSL	Q96GA7	329 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SLC25A22	Q9H936	323 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SIRPB1	O00241	398 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	CST2	P09228	141 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	TDGF1	P13385	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	MLF1	P58340	268 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	LRTM2	Q8N967	370 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	OR4F5	Q8NH21	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	LURAP1	Q96LR2	239 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	DEPP	Q9NTK1	212 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	C9orf172	C9J069	976 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	TMEM50A	O95807	157 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	BCL2	P10415	239 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	H3F3A	P84243	136 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	WASF3	Q9UPY6	502 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	PINLYP	A6NC86	204 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	ARGFX	A6NJG6	315 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	HOXA6	P31267	233 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	PMEL	P40967	661 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	UCP3	P55916	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	MALSU1	Q96EH3	234 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SYNGR2	O43760	224 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	ZNF737	O75373	536 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	KRAS	P01116	189 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	F2R	P25116	425 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	FADS6	Q8N9I5	356 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	GPR146	Q96CH1	333 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	ADGRG7	Q96K78	797 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	VSIR	Q9H7M9	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542		Q9N2K0	584 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	DEGS1	O15121	323 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SYNGR1	O43759	233 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	MT-CO3	P00414	261 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	CTXN2	P0C2S0	81 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	CST9LP1	Q5W188	147 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	C12orf49	Q9H741	205 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRMT7-223	ENST00000567542	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	DDT	P30046	118 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	PSMB3	P49720	205 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	OR8B8	Q15620	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	DEFB124	Q8NES8	71 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	GPR87	Q9BY21	358 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	XKRY2	A2RUG3	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	SCGB1D1	O95968	90 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	CRYGS	P22914	178 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	MAGEA5	P43359	124 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	RAB40C	Q96S21	281 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	RBKS	Q9H477	322 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	GPR35	Q9HC97	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PRMT7-223	ENST00000567542	SPINK9	Q5DT21	86 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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