RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 DNAH2Q9P225 4427 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF785A8K8V0 405 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 GNGT2O14610 69 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 TRGV3P03979 118 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 CD7P09564 240 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ZP3P21754 424 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 SYNJ2BPP57105 145 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 CX3CL1P78423 397 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF85Q03923 595 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ACTBL2Q562R1 376 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF691Q5VV52 312 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 PXT1Q8NFP0 134 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM163Q8TC26 289 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 NEURL2Q9BR09 285 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 FBXL15Q9H469 300 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ETAA1Q9NY74 926 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 GAB2Q9UQC2 676 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 TPPPO94811 219 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 MT-ND4P03905 459 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 EPHA2P29317 976 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 DYRK1AQ13627 763 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 STEAP3Q658P3 488 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 LFNGQ8NES3 379 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 IFT22Q9H7X7 185 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 GNG8Q9UK08 70 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A0J9YWU9 116 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 OR11H12B2RN74 326 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 GABRPO00591 440 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 RRHO14718 337 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 HTR3BO95264 441 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 DAPP51397 102 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 MORN2Q502X0 79 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 FDX2Q6P4F2 183 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ASCL4Q6XD76 172 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 GID4Q8IVV7 300 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 OR1L1Q8NH94 360 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 RDH12Q96NR8 316 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 GNG12Q9UBI6 72 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 RNF150Q9ULK6 438 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 AIPO00170 330 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 SPINT2O43291 252 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 SULT1B1O43704 296 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 TRBV12-3P01733 135 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 HBZP02008 142 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 TFAP2AP05549 437 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 CD40LGP29965 261 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 OR3A3P47888 321 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ALDH3A2P51648 485 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 CCR9P51686 369 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 PRR20EP86478 221 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 PRR20CP86479 221 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 PRR20DP86480 221 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 PRR20BP86481 221 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 PRR20AP86496 221 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 RSU1Q15404 277 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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