RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557718.5

FOXN3-218, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 5

Gene FOXN3, Length 398 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-218ENST00000557718 FAM189A2Q15884 450 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 C17orf58Q2M2W7 97 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 KRBOX4Q5JUW0 171 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 Q6ZS49 121 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 C11orf42Q8N5U0 333 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 UBALD1Q8TB05 177 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 CCDC107Q8WV48 283 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 RAB1CQ92928 201 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 BORCS5Q969J3 196 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 MRGPRFQ96AM1 343 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 PHF21AQ96BD5 680 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 FAM234AQ9H0X4 552 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 RABL2BQ9UNT1 228 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 TNCP24821 2201 aa4.88□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 MEIKINA0A087WXM9 373 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 A8MXK9 166 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 C12orf77C9JDV5 145 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 M0QYG6 137 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 NDUFA2O43678 99 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 MMP23AO75900 390 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 CD74P04233 296 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 CD3DP04234 171 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 GSTT2P0CG29 244 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 GSTT2BP0CG30 244 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 GYPEP15421 78 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 SPNP16150 400 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 CCL3L1P16619 93 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 NDUFB7P17568 137 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 HLA-DMAP28067 261 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 RCVRNP35243 200 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 SSTR5P35346 364 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 PTTG1IPP53801 180 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 DLX1P56177 255 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 HLA-DRB3P79483 266 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 ARL6IP1Q15041 203 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 20.1
FOXN3-218ENST00000557718 CLEC12BQ2HXU8 276 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 IGSF11Q5DX21 431 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 Q5PR19 223 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 GLCCI1Q86VQ1 547 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 SPICQ8N5J4 248 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 TMEM229BQ8NBD8 167 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 LY6G5BQ8NDX9 201 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 BEST4Q8NFU0 473 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 OR4C16Q8NGL9 310 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 OR1L1Q8NH94 360 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 C8orf46Q8TAG6 207 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 MRGPRDQ8TDS7 321 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 NEK7Q8TDX7 302 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 ZFAND2BQ8WV99 257 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 FCAMRQ8WWV6 532 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 NINJ1Q92982 152 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 TIMD4Q96H15 378 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 MED30Q96HR3 178 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 HRASLSQ9HDD0 168 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 GLS2Q9UI32 602 aa4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 MTORP42345 2549 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 TRDCB7Z8K6 153 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 H3BUI4 141 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 NDUFS8O00217 210 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 FABP7O15540 132 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 NDUFB3O43676 98 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 RBBP9O75884 186 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 HBZP02008 142 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 PMP2P02689 132 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 HRH1P35367 487 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 CBX5P45973 191 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 EDDM3BP56851 147 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 CD69Q07108 199 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 ASAH1Q13510 395 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 GNMTQ14749 295 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 KCNJ8Q15842 424 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 LRRC10Q5BKY1 277 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 TRIQKQ629K1 86 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 STEAP1BQ6NZ63 245 aa4.86□□□□□ -1.63
FOXN3-218ENST00000557718 CLEC2AQ6UVW9 174 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms