RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	C17orf50	Q8WW18	174 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	DYRK2	Q92630	601 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	LEAP2	Q969E1	77 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	ARL11	Q969Q4	196 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	CST11	Q9H112	138 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	ETAA1	Q9NY74	926 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994		V9GY05	133 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	PLXNB1	O43157	2135 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A087WXM4	84 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	C17orf98	A8MV24	154 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994		H3BUX3	64 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	AIP	O00170	330 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	TIMM23	O14925	209 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	MMP23A	O75900	390 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	TNFAIP8	O95379	198 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	LPL	P06858	475 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	MELTF	P08582	738 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	UCHL1	P09936	223 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	UBB	P0CG47	229 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	CD36	P16671	472 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	RAB3B	P20337	219 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	GZMH	P20718	246 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	GADD45A	P24522	165 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	CD24	P25063	80 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	IER3	P46695	156 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	OR10A3	P58181	314 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	IL13RA2	Q14627	380 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	SSX1	Q16384	188 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	IDNK	Q5T6J7	187 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994		Q6ZTK2	550 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	CDH26	Q8IXH8	852 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM104	Q8NE00	496 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	PHYHIP	Q92561	330 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	FCGR1B	Q92637	280 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	PHF21A	Q96BD5	680 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	COQ2	Q96H96	371 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	CITED1	Q99966	193 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	CHIA	Q9BZP6	476 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	OR51E2	Q9H255	320 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	STUB1	Q9UNE7	303 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A0B4J203	849 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	LEUTX	A8MZ59	168 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	F2RL2	O00254	374 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC17A2	O00624	439 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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