RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IFITM5A6NNB3 132 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 KLK8O60259 260 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 HPNP05981 417 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A4P12235 298 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR1E2P47887 323 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R1AQ13522 171 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SRD5A3Q9H8P0 318 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G3Q9NZ20 509 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF253O75346 499 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF683Q8IZ20 524 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM123Q8N131 208 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PR48 441 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PR77 199 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G10O15496 165 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 CCL4P13236 92 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 PSMB10P40306 273 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 PGGT1BP53609 377 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 TCF24Q7RTU0 167 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 NAA60Q9H7X0 242 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 GNG12Q9UBI6 72 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 EVPLQ92817 2033 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 OR2M5A3KFT3 312 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 H3BVH4 76 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 P2RY10O00398 339 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SH2D1BO14796 132 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 DHHO43323 396 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 IL11P20809 199 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 FCGR2CP31995 323 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MPV17LQ2QL34 196 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 DOK4Q8TEW6 326 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 Q8WTZ3 238 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 WNT2BQ93097 391 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 FEVQ99581 238 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 RARRES2Q99969 163 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0A6YYD5 115 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 APOMO95445 188 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 LIFP15018 202 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ATP5J2P56134 94 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 FUT7Q11130 342 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 FAM57BQ71RH2 274 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 NUP37Q8NFH4 326 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 OR10D3Q8NH80 312 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SDF2Q99470 211 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 GP6Q9HCN6 339 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ONECUT1Q9UBC0 465 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MSTNO14793 375 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 GDF9O60383 454 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 NEURL1O76050 574 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFB6O95139 128 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 HBZP02008 142 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 IFITM1P13164 125 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 WDR82Q6UXN9 313 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 NHLRC1Q6VVB1 395 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 OR8B2Q96RD0 313 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SYNPO2LQ9H987 977 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 KNL1Q8NG31 2342 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 F5P12259 2224 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 F5H768 121 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 CEACAM4O75871 244 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 NKX2-2O95096 273 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 GLIPR1P48060 266 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 LHX2P50458 406 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms