RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
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PTPRB-204ENST00000538708 PRNTQ86SH4 94 aa8.15□□□□□ -1.11
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PTPRB-204ENST00000538708 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-204ENST00000538708 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-204ENST00000538708 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRB-204ENST00000538708 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRB-204ENST00000538708 VSIG8P0DPA2 414 aa8.14□□□□□ -1.11
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