RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 RAB40CQ96S21 281 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 SIVA1O15304 175 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 DDAH2O95865 285 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 GNB2P62879 340 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 AESQ08117 197 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 Q0VG73 95 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 SDSLQ96GA7 329 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 ABI3Q9P2A4 366 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 TBX21Q9UL17 535 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.59□□□□□ -1.19
GPBP1-208ENST00000514387 ZFP92A6NM28 416 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 MT-CO2P00403 227 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 CGAP01215 116 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SRD5A2P31213 254 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PPP1CBP62140 327 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF77Q15935 545 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PP6455Q8WZ26 134 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 MMP17Q9ULZ9 603 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TRPM6Q9BX84 2022 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 AQP7P3A6NL99 342 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 C11orf98E9PRG8 122 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 LILRA1O75019 489 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF737O75373 536 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 DGAT2Q96PD7 388 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 KCNK17Q96T54 332 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 HCSTQ9UBK5 93 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 A0A1W2PRU2 124 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 HS3ST1O14792 307 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 WNT2P09544 360 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 MSMO1Q15800 293 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TDRG1Q3Y452 100 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF585BQ52M93 769 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SLC39A11Q8N1S5 342 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 RPRMQ9NS64 109 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PILRBQ9UKJ0 227 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PSG8Q9UQ74 426 aa7.58□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF814B7Z6K7 855 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 H0YGG7 62 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TMPRSS2O15393 492 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 MPPED1O15442 326 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 NRASP01111 189 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 KRASP01116 189 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 VDAC1P21796 283 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 HERV-K104P61576 105 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 RUNX1Q01196 453 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ASCL4Q6XD76 172 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF695Q8IW36 515 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 Q96M66 194 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 UTS2O95399 124 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 GYPAP02724 150 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 CD55P08174 381 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 AZU1P20160 251 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 IL3RAP26951 378 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms