RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 CCRL2O00421 344 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 LDLRAD4O15165 306 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1D-33P01593 117 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1-33P01594 117 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 CD28P10747 220 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 HMGN3Q15651 99 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 Q6ZTK2 550 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 AK3Q9UIJ7 227 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 V9GY05 133 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 PLXNB1O43157 2135 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-218ENST00000511185 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 NAPSAO96009 420 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 LPLP06858 475 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB7AP51149 207 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 HES1Q14469 280 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf88Q6PI97 169 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF773Q6PK81 442 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 OR8H3Q8N146 312 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO24O75426 580 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM11P17152 192 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 VEGFCP49767 419 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 HNF4GQ14541 408 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 PLAC9Q5JTB6 97 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 C10orf99Q6UWK7 81 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM89BQ8N5H3 189 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 SETD6Q8TBK2 473 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 MMP27Q9H306 513 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 MYL9P24844 172 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM50BP56557 158 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 MOB3BQ86TA1 216 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 JPT1Q9UK76 154 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 NOTCH1P46531 2555 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 IFITM5A6NNB3 132 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM106CPP0CH98 169 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF137PP52743 207 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 NEDD8Q15843 81 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 Q3ZCU0 254 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 MORN2Q502X0 79 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 Q8N6K4 173 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 FCGR1BQ92637 280 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 PECRQ9BY49 303 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC42Q9Y546 428 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 PEX14O75381 377 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 CSF1P09603 554 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB3BP20337 219 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 IL3RAP26951 378 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 OR51E2Q9H255 320 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms