RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 UQCC2Q9BRT2 126 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 MND1Q9BWT6 205 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 PDCD6O75340 191 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 PF4P02776 101 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 GLAP06280 429 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 VSIG8P0DPA2 414 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 FUT3P21217 361 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 CHATP28329 748 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 CD1BP29016 333 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 UNC119Q13432 240 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM30BQ3MIR4 351 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 ACSM3Q53FZ2 586 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 C1orf100Q5SVJ3 147 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 C6orf183Q5T699 404 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 OR2W3Q7Z3T1 314 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC35E3Q7Z769 313 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 STPG2Q8N412 459 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 MRAPQ8TCY5 172 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 CHPT1Q8WUD6 406 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 GFI1Q99684 422 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 SULT4A1Q9BR01 284 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 ABCG5Q9H222 651 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 TAF9BQ9HBM6 251 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 NOTCH3Q9UM47 2321 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A0A6YYD4 124 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 SERPINE3A8MV23 424 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 SPINT2O43291 252 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 CA11O75493 328 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 MPIG6BO95866 241 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 HSMCR30P0CW71 290 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 GPR12P47775 334 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 KRTAP10-11P60412 298 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 QRFPP83859 136 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 GPR50Q13585 617 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 MORN2Q502X0 79 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 PRR18Q8N4B5 295 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 OR52L2PQ8NGH6 319 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 PHYHIPQ92561 330 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 THRSPQ92748 146 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 NICN1Q9BSH3 213 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 TMED9Q9BVK6 235 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 GNG12Q9UBI6 72 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 GHRLQ9UBU3 117 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM14DPA8MWL7 114 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 K7EIL1 84 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC22A1O15245 554 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 LANCL1O43813 399 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 MOSP00540 346 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 UCHL1P09936 223 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 IL3RAP26951 378 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 HTR2CP28335 458 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 THBS3P49746 956 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 F2RL1P55085 397 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 CFHR3Q02985 330 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 LSAMPQ13449 338 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 HMGN3Q15651 99 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 LIPKQ5VXJ0 399 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF554Q86TJ5 538 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM203Q969S6 136 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 S1PR3Q99500 378 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 P2RX4Q99571 388 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 TM2D1Q9BX74 207 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 TXNL1O43396 289 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 STEAP3Q658P3 488 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 C6orf201Q7Z4U5 140 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 SVOPQ8N4V2 548 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 CST11Q9H112 138 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 Q9H521 79 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 JPT1Q9UK76 154 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-216ENST00000510193 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-216ENST00000510193 AP4M1O00189 453 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-216ENST00000510193 YPEL1O60688 119 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP2-216ENST00000510193 NAPSAO96009 420 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms