RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 KCNJ8Q15842 424 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 DUSP7Q16829 419 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 CYP51A1Q16850 503 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 IMPG1Q17R60 797 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF404Q494X3 552 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SLC36A2Q495M3 483 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 MUC21Q5SSG8 566 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 GPR107Q5VW38 600 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 EMBQ6PCB8 327 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 LYPD2Q6UXB3 125 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 STX12Q86Y82 276 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC8AQ8IWT6 810 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 FAM86B1Q8N7N1 296 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 RFESDQ8TAC1 157 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 UFD1Q92890 307 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 MYDGFQ969H8 173 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PPCDCQ96CD2 204 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 RAB3CQ96E17 227 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR2M2Q96R28 347 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR2V2Q96R30 315 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SLC29A1Q99808 456 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SH3GL3Q99963 347 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 HINT2Q9BX68 163 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR2J1Q9GZK6 312 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF702PQ9H963 129 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 THYN1Q9P016 225 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 RNF24Q9Y225 148 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SAR1BQ9Y6B6 198 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 C5orf49A4QMS7 147 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 MANBAO00462 879 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PPP1R2P9O14990 202 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SIVA1O15304 175 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 CHST1O43916 411 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PRKYO43930 277 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SMIM24O75264 130 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 FCN3O75636 299 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PIAS1O75925 651 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 AHSA1O95433 338 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 IGF2P01344 180 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 TFPTP0C1Z6 253 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PMCHP20382 165 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 IL12AP29459 219 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PRKXP51817 358 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 MFAP2P55001 183 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 RND3P61587 244 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PPP1CBP62140 327 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ERVK-25P63136 954 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 IL5RAQ01344 420 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 GNMTQ14749 295 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OXA1LQ15070 435 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF141Q15928 474 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 TIGITQ495A1 244 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 C1orf140Q5VVS0 124 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 DPPA2Q7Z7J5 298 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 CMC1Q7Z7K0 106 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SKA3Q8IX90 412 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 C20orf196Q8IYI0 205 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 RORBQ92753 470 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 C11orf52Q96A22 123 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 MS4A14Q96JA4 679 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OXGR1Q96P68 337 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 SDF2Q99470 211 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 GPR22Q99680 433 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 EMC6Q9BV81 110 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 CDCA4Q9BXL8 241 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 OR51M1Q9H341 326 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 RBKSQ9H477 322 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 IL1RAPQ9NPH3 570 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 PCTPQ9UKL6 214 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-217ENST00000509355 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms