RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS13AQ96RL7 3174 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 LRP4O75096 1905 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC22A20A6NK97 555 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 PAGE4O60829 102 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 HPXP02790 462 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SP1P08047 785 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLC1P0CG04 106 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM225BP0DP42 221 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 COX6A1P12074 109 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF17P17021 662 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 NPY1RP25929 384 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 KIR2DS4P43632 304 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SSR4P51571 173 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FUT6P51993 359 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TCTAP57738 103 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ID3Q02535 119 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 IHHQ14623 411 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OPN5Q6U736 354 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 EPGNQ6UW88 154 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF429Q86V71 674 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 CALHM3Q86XJ0 350 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR1J1Q8NGS3 322 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 DUX3Q96PT4 197 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 DOHHQ9BU89 302 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 EGLN3Q9H6Z9 239 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 KLK11Q9UBX7 282 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SCN8AQ9UQD0 1980 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PPV9 198 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM189A5PLL7 270 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR51F1A6NGY5 319 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 B4DEV8 164 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR1I1O60431 355 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2A4O95047 310 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 AIFM1O95831 613 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 CXCL1P09341 107 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 LYL1P12980 280 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL7P18124 248 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 PRKACGP22612 351 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 C3AR1Q16581 482 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SIAH3Q8IW03 269 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5AN1Q8NGI8 311 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 NUDT8Q8WV74 236 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MUCL1Q96DR8 90 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 HSH2DQ96JZ2 352 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2A7Q96R45 310 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGIXQ9H6Y5 334 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SERHLQ9NQF3 203 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SERTAD4Q9NUC0 356 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA1456Q9P272 454 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPN13Q12923 2485 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A087WUU8 490 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ASPDHA6ND91 283 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TPST2O60704 377 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 EEDO75530 441 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 GABRA3P34903 492 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 VWC2Q2TAL6 325 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF750Q32MQ0 723 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF66Q6ZN08 573 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF611Q8N823 705 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF675Q8TD23 568 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 FCAMRQ8WWV6 532 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ZMAT4Q9H898 229 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 ALKBH4Q9NXW9 302 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNE5Q9UJ90 142 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-213ENST00000496055 MAST4O15021 2626 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-213ENST00000496055 ERI3O43414 337 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-213ENST00000496055 NTF3P20783 257 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC6A9P48067 706 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-213ENST00000496055 MARCKSL1P49006 195 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-213ENST00000496055 DIO3P55073 304 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAM8P78325 824 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-213ENST00000496055 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF684Q5T5D7 378 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-213ENST00000496055 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM40Q6P9F5 258 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-213ENST00000496055 PLXDC2Q6UX71 529 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-213ENST00000496055 LAS2Q8IYD9 372 aa3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms