RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 HBZP02008 142 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 HEXAP06865 529 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SOD3P08294 240 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CXCL3P19876 107 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 PI3P19957 117 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 VAMP1P23763 118 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 COL8A2P25067 703 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 IL2RGP31785 369 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ABCA11PQ4W5N1 156 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SGPP2Q8IWX5 399 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 OR1L1Q8NH94 360 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 GALMQ96C23 342 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 PHB2Q99623 299 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 JMJD1CQ15652 2540 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1B0GW55 424 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 C15orf65H3BRN8 121 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 GPR31O00270 319 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SPINT2O43291 252 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 HSPA12AO43301 675 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC22A5O76082 557 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SELLP14151 372 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DNASE1P24855 282 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 EDDM3BP56851 147 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 PIGPP57054 158 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 RND3P61587 244 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 PRR18Q8N4B5 295 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ASB13Q8WXK3 278 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ARL11Q969Q4 196 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB9BQ9NP90 201 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DUX4Q9UBX2 424 aa8.91□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 GOSR2O14653 212 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TMPRSS2O15393 492 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ADAM20O43506 726 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 RP2O75695 350 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 OR2A4O95047 310 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 IFNA2P01563 188 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 C1QBP02746 253 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CGB3P0DN86 165 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CGB7P0DN87 165 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 HLA-GP17693 338 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 GNRHRP30968 328 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CEACAM6P40199 344 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 HTD2P86397 168 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ZFP69Q49AA0 526 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 COQ8AQ8NI60 647 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 UBALD1Q8TB05 177 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CORO2AQ92828 525 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 GALNT14Q96FL9 552 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 OR2A7Q96R45 310 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 NAA60Q9H7X0 242 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 RDH8Q9NYR8 311 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.9□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms